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liulovewang新虫 (初入文坛)
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NAMD模拟过程的原子坐标
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| NAMD模拟设置了一定时间间隔将原子坐标文件写入了dcd文件,怎么读取这个文件?我想知道过程中的原子坐标。谢谢大家。 |
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liulovewang
新虫 (初入文坛)
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2楼2013-01-16 21:59:16
【答案】应助回帖
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建议好好学习一下VMD : 坐标: mol load psf yourfile.psf dcd yourfile.dcd set sel [atomselect top "the atoms you need"] $sel get {x y z} 怎么替换,你懂的 怎么保存你去看手册 补充, 可以得到,具体你需要什么能量体系,去看看NAMD 手册 Pair_interactions |
3楼2013-01-16 22:14:57
fhh2626
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