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汕头大学海洋科学接受调剂
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暖水袋

金虫 (初入文坛)

[求助] 求用到AMBER force field的开源软件

本人急需一些关于使用到AMBER力场的开源软件的代码,最好是用C++写的,需要在自己的程序中植入调用amber力场的代码,求大侠帮忙。金币可以给更多,万分感谢!
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
暖水袋: 金币+2, 有帮助, 谢谢提醒,我会好好去看看 2013-01-29 09:16:31
我没有用过amber力场。抱歉

在gromacs中的工具  pdb2gmx  中有选择力场的选项,你可以看看这个这工具的源程序。

虽然都是amber力场,但是不同软件中的公式形式和单位是不同的,使用的时候,一定要注意
10楼2013-01-18 15:43:33
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查看全部 11 个回答

暖水袋

金虫 (初入文坛)

谢谢楼上的热情回复,我去看了下,跟我想要的有点区别,但还是非常感谢
2楼2013-01-16 14:56:52
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
暖水袋: 金币+3, ★★★很有帮助, 因为这几个我都之前下好的,所以少給几个金币,还是谢谢 2013-01-18 09:24:03
你去看看NAMD 和gromacs的源程序吧,这两个都可以调用amber力场

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2013-01-16 15:02:18
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yaozhq

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
暖水袋: 金币+3, ★★★很有帮助, 因为这几个我都之前下好的,所以少給几个金币,还是谢谢 2013-01-18 09:24:17
引用回帖:
3楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2013-01-16 15:02:18
你去看看NAMD 和gromacs的源程序吧,这两个都可以调用amber力场

最常见的就是这两个了 如果lz有amber也可以直接看代码
4楼2013-01-16 15:14:14
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