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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » MEGA同源性分析
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liuhaiyang

新虫 (小有名气)

[求助] MEGA同源性分析

如题，小弟利用MEGA软件进行了不同菌株的同源性分析，结果如图，但是小弟不太清楚此图该如何解释。
接点上的数字是否为自展支持率？我的图上面数字好多为零代表什么意思？图下面的标尺什么意思？

图片2.png
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1楼 2013-01-10 18:20:25
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alin0010

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

进化树上的分支是按亲缘关系远近来划分的，同一个分支上的分离物说明他们亲缘关系很近
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2楼2013-01-20 11:52:16
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liuhaiyang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by alin0010 at 2013-01-20 11:52:16
进化树上的分支是按亲缘关系远近来划分的，同一个分支上的分离物说明他们亲缘关系很近

麻烦看一下，此张图有价值么???
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3楼2013-01-21 17:14:42
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王zmm

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

0应该是指的进化年数吧。如果建进化树的时候用的序列同源性都很高，建的树就会出现你这种情况
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4楼2013-01-29 09:02:58
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

最好还是使用模型构建个进化树，看得清楚些。节点的数字一般表示支持率。祝好！
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liuhaiyang
将相本无种★男儿当自强
5楼2013-01-29 18:54:16
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liuhaiyang

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by rommel1941 at 2013-01-29 18:54:16
最好还是使用模型构建个进化树，看得清楚些。节点的数字一般表示支持率。祝好！

麻烦问一下，这张图可以用么？
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6楼2013-01-31 11:57:15
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河
这个真不好说，要看你选的物种的关系，不过还是不建议使用。最好是使用多种方法建树，在比较。你用的是Bootstrap方法吗？重复多少次？
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将相本无种★男儿当自强
7楼2013-01-31 12:41:45
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liuhaiyang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by rommel1941 at 2013-01-31 12:41:45
这个真不好说，要看你选的物种的关系，不过还是不建议使用。最好是使用多种方法建树，在比较。你用的是Bootstrap方法吗？重复多少次？

是用的Bootstrap方法，
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8楼2013-02-01 11:55:44
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
liuhaiyang: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常感谢！ 2013-02-01 18:51:51
要么是信息量小，要么就是你选的物种关系太近，抑或你选的建树方法有问题。不过要结合你讨论的问题、物种、标记综合考虑，这张图临时应付一下老板倒是可以，往论文上写的话要慎重。
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将相本无种★男儿当自强
9楼2013-02-01 15:38:09
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liuhaiyang

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by rommel1941 at 2013-02-01 15:38:09
要么是信息量小，要么就是你选的物种关系太近，抑或你选的建树方法有问题。不过要结合你讨论的问题、物种、标记综合考虑，这张图临时应付一下老板倒是可以，往论文上写的话要慎重。

谢谢你了!500个碱基对左右，应该是菌株亲缘关系太近的原因。
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10楼2013-02-01 18:51:35
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