关于genome duplication 的计算时,有文献这样做的:基因复制(gene duplication) 是多基因家族中普遍存在的方式, 通过不等交换(unequal crossing over)、逆转录转
座(retroposition) 或全基因组重复(whole genome duplica-tion) 等途径产生一个与原基因相似的基因或碱基序列, Bai 等[16]将基因复制概念归纳为两个特征, 即发生基因重复的两个基因序列之间有大于 70% 的核苷酸序列可以排列; 可排列的区域氨基酸序列的序列相似度大于 70% 。通过对基因复制的研究, 能更好地理解基因的起源、基因家族的形成、基因表达水平的多样性[17]。利用 MEGA3.1中的ClustalW 模块将所有的玉米NBS 类型抗病基因进行排序, 再将排序结果进行基因间序列相似度计算, 根据计算结果统计基因复制事件。
请问:这个具体是怎么做的?mega
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