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tdairy09

金虫 (正式写手)

[求助] MEGA软件能不能多条DNA序列比对后, 将差异位点集合到一起显示出来 已有1人参与

什么软件能多条DNA序列比对后, 将差异位点集合到一起显示出来?如何做呢?谢谢!新年快乐!
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在坚持中创新
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牧炀

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-01-10 09:08:14
差异位点  我做的都是相同功能位点比较  剩下的就是差异的了啊……
2楼2014-01-10 08:35:50
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tdairy09

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 牧炀 at 2014-01-10 08:35:50
差异位点  我做的都是相同功能位点比较  剩下的就是差异的了啊……

请问怎么操作呢,我不大会用这些软件,还请多多指教,谢谢!
在坚持中创新
3楼2014-01-10 08:39:44
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牧炀

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
kx444555: 金币+5, 鼓励交流 2014-01-10 13:44:56
tdairy09: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2014-01-10 18:03:57
引用回帖:
3楼: Originally posted by tdairy09 at 2014-01-10 08:39:44
请问怎么操作呢,我不大会用这些软件,还请多多指教,谢谢!...

我用的MEGA5.0的版本,把序列先在记事本里整理成FASTA的格式,然后将记事本txt的后缀改成fasta,这个格式的话就是大致如下:

>名字(不能有空格 有罗马的I II这样的字符)
>JKHFYUDSFGJKGHI……(序列)

这里的“>”不能去掉的


然后打开MEGA  运行exe程序,会出现一个confirm的对话框  要选NO  再打开File——open a file

接着在analyze or align file的对话框中选 align

出现下一个对话框后  选择菜单栏里的alignment中的align by clustalW


我是这么做的...不知道能不能出你想要的结果
4楼2014-01-10 12:39:33
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tdairy09

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 牧炀 at 2014-01-10 12:39:33
我用的MEGA5.0的版本,把序列先在记事本里整理成FASTA的格式,然后将记事本txt的后缀改成fasta,这个格式的话就是大致如下:

>名字(不能有空格 有罗马的I II这样的字符)
>JKHFYUDSFGJKGHI……(序列)
...

谢谢你详细的解答,比对完之后,只想要差异位点的话,是不是只能手动把相同位点删除呢?
在坚持中创新
5楼2014-01-10 18:05:37
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我的翼瑟

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by tdairy09 at 2014-01-10 18:05:37
谢谢你详细的解答,比对完之后,只想要差异位点的话,是不是只能手动把相同位点删除呢?...

请问只有手动删除么?
6楼2016-01-12 21:09:11
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