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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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apple712

银虫 (初入文坛)

[求助] southern blot问题求助

最近要做Southern BLOT,目的是想看我手上的基因在植物体中有几个同源基因。有几个问题想请教大家。
1)只知道southern 可以看基因的拷贝数,也可以看有几个同源基因吗(问的比较弱智,大家见谅)?
2)如果可以看同源基因,而这些同源基因大小都差的不是很多的话,通过southern能看出来吗?
3)既然我是要看有几个同源基因的话,探针是不是应该设计在保守区? 以上问题,请各位大虾指点,谢谢。
4) 所用到的探针是怎么合成的?长度应该为多长?其杂交温度如何确定?
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2011sp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1)看你基因同源性;这里指的是在DNA水平,蛋白水平的意义不大。只要同源性比较高,能保证Southen Blot 能杂交上,就可以检测你的同源基因的拷贝数。
2)这种情况通过杂交信号的强弱是可以判断出来的,也可以用一些软件计算出拷贝数
3)探针是应该设计在保守区
4)有PCR法、合成法等。
2楼2012-11-25 19:02:43
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