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apple712

银虫 (初入文坛)

[求助] southern blot问题求助

最近要做Southern BLOT，目的是想看我手上的基因在植物体中有几个同源基因。有几个问题想请教大家。
1）只知道southern 可以看基因的拷贝数，也可以看有几个同源基因吗（问的比较弱智，大家见谅）？
2）如果可以看同源基因，而这些同源基因大小都差的不是很多的话，通过southern能看出来吗？
3）既然我是要看有几个同源基因的话，探针是不是应该设计在保守区？ 以上问题，请各位大虾指点，谢谢。
4） 所用到的探针是怎么合成的？长度应该为多长？其杂交温度如何确定？
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1楼 2012-11-24 14:26:51
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2011sp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1)看你基因同源性；这里指的是在DNA水平，蛋白水平的意义不大。只要同源性比较高，能保证Southen Blot 能杂交上，就可以检测你的同源基因的拷贝数。
2）这种情况通过杂交信号的强弱是可以判断出来的，也可以用一些软件计算出拷贝数
3）探针是应该设计在保守区
4）有PCR法、合成法等。
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2楼2012-11-25 19:02:43
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