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同源模型的建立
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wwb168
银虫
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专业: 药物设计与药物信息
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同源模型的建立
本人是初学者,由于老板要求做MTOR抑制剂同源模型的建立,本人无从下手,跪求高手帮忙!
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1楼
2012-11-01 16:42:21
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ningjianan
铁虫
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注册: 2015-11-16
专业: 基础兽医学
引用回帖:
5楼
:
Originally posted by
Tavel
at 2012-11-29 16:54:03
呵呵,先让我老板提供同源模建的工具啊,SYBYL的同源模建工具不错,分步模建,模板搜索--构建主链--构建侧链--构建loop区--模型检查--模型优化分步进行,便于发现问题并及时改正。
请问SYBYL模建出来的蛋白没有二级结构,问题出在哪里?
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9楼
2016-08-23 09:48:36
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messi1910
铜虫
(初入文坛)
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注册: 2012-10-30
专业: 生物信息学
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zh1987hs: 金币+1, 谢谢
2012-11-03 16:29:20
蛋白质的同源建模吗?可以用swiss-model在线的服务
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2楼
2012-11-01 16:58:41
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liuwei4410
金虫
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专业: 生物信息学
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2012-11-03 16:29:26
modeller也可以,我用的modeller!
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一切都是浮云,开心最重要!
3楼
2012-11-03 16:18:08
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zh1987hs
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分子模拟新手
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性别: GG
专业: 环境生物物理
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chaizhm: 金币+2, 谢谢~
2012-11-30 09:25:32
1.上网查阅同源模建的基本概念与适用范围,初步明确自己的体系是否可以用同源模建构建三维结构。
2.选择合适的同源模建软件,如在线的swiss-model和可本地安装的modeller,对其使用和结果分析有初步的了解,进一步的优化蛋白结构。
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4楼
2012-11-03 19:42:41
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