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beescity

至尊木虫 (著名写手)

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[求助] 引物设计跨内含子，操作中如何快速实现？

经常都在说检测mRNA，引物设计要跨内含子，道理也知道。
大家平时在实际操作时候，是如何实现的啊？
难道设计出来了之后手动去某段引物是不是在一个外显子的边缘，另一个又是在相邻外显子？这个方法是不是太慢了？

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1楼2012-10-29 14:18:19

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beescity

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引用回帖:

9楼: Originally posted by 547star at 2012-10-31 08:30:29
有mDNA和genome DNA序列,找出mRNA中外显子拼接的地方,没有太多可以挑选的.至于DNase处理的mRNA样品...如果是做定量PCR,就我看到生工之类引物合成公司帮设计的,就没考虑跨内含子的.当然,如果你也用这样的方法,个人建 ...

老兄，找出拼接地方之后怎么操作？把这部分序列粘出来？然后设计。还是用整个cDNA序列设计之后看哪些引物落在这个区域。有图解么？人太低端了，理解不了。