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zhangzhengc木虫 (正式写手)
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[求助]
关于sio2的模拟
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有人做过SIO2的分子动力学模拟吗？我现在想用gromacs做SIO2的模拟，用BKS和CHIK势能模型，但是做出来的数据和文献的有很大差别。文献中没有写是用什么的模拟软件，我看了别人写的itp文件，和我写的一样的，但是就是和文献中结果不同。 [ defaults ] 2 1 ; Buckingam potential [ atomtypes ] ; name mass charge ptype c6 c12 O 15.99940 -1.200 A 0.22617E-02 0.74158E-06 0.0000; Si 28.08000 2.400 A 0.14738E-01 0.22191E-04 0.0000; [ nonbond_params ] O O 2 1.339973E+5 27.6 1.688507E-2 O Si 2 1.737112E+6 48.7318 1.288457E-2 Si Si 2 0 0 0 [ moleculetype ] O 0 [ atoms ] 1 O 1 O O 1 -1.2 15.99940 [ moleculetype ] Si 0; [ atoms ] 1 Si 1 Si Si 2 2.4 28.08000 [ system ] Silica [ molecules ] O 48 Si 24 上面是我的top文件 |
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