24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 7021  |  回复: 5

彩虹菲儿

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何从NCBI上下载菌株的16S rDNA序列,请问在NCBI上如何下载?

为构建系统发育树,需要从NCBI上下载亲缘较近的菌株的16S rDNA序列,请问在NCBI上如何下载?希望大神们给出具体步骤!谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-10-09 15:42:53
用你克隆的序列直接到NCBI比对就行了。
如果你没有序列,就查一下其他人发表的PAPER,选其中一个16S rDNA序列再去比对。
2楼2012-10-09 11:13:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

彩虹菲儿

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chenguestc at 2012-10-09 11:13:25
用你克隆的序列直接到NCBI比对就行了。
如果你没有序列,就查一下其他人发表的PAPER,选其中一个16S rDNA序列再去比对。

请问在NCBI上建的系统发育树如何下载?直接下载打开是乱码,且不能编辑
3楼2012-10-10 17:06:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

1,截图,然后再PHOTOSHOP里CROP一下就行了。
2,把这些序列拷贝出来,到BIOEDIT或者MEGA等软件里重新做系统发育树都是可以的。
4楼2012-10-11 08:45:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhoufeng1982

木虫 (著名写手)

知道了啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊啊
5楼2012-10-11 09:06:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aloon111

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
比对后勾选想要的菌株,点send to,直接存为fasta格式的文档,这是批量下载,快的很。再用软件做树。
汇天下之贤
6楼2012-10-11 10:31:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 彩虹菲儿 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 262求调剂 +3 天下第一文 2026-04-04 4/200 2026-04-05 17:07 by yulian1987
[考研] 一志愿9材料学硕297已过六级求调剂推荐 +10 adaie 2026-04-04 11/550 2026-04-05 12:28 by 418490947
[考研] 283求调剂 +10 A child 2026-04-04 10/500 2026-04-05 08:22 by qlm5820
[考研] 调剂 +8 熊二想上岸 2026-04-04 8/400 2026-04-05 05:27 by houyaoxu
[考研] 283分求调剂 +7 小聂爱学习 2026-04-03 7/350 2026-04-04 21:51 by hemengdong
[考研] 调剂 +4 是可乐不是可乐 2026-04-04 4/200 2026-04-04 19:41 by 唐沐儿
[考研] 一志愿武理材料工程302调剂环化或化工 +19 Doleres 2026-03-31 20/1000 2026-04-04 16:44 by 啊俊!
[考研] 309求调剂 +4 快乐的小白鸽 2026-04-04 5/250 2026-04-04 15:55 by cql1109
[考研] 348分环境工程·调剂 +10 吴彦祖24k 2026-04-03 11/550 2026-04-04 14:19 by 无际的草原
[考研] 085600材料与化工调剂 +26 kikiki7 2026-03-30 27/1350 2026-04-04 09:18 by qlm5820
[考研] 295求调剂 +3 尚偌呀 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:23 by zhq0425
[考研] 334求调剂 +9 Trying] 2026-03-31 9/450 2026-04-03 15:18 by 琢珥丶
[考研] 285求调剂 +7 AZMK 2026-04-02 9/450 2026-04-03 11:12 by wanwan00
[考研] 一志愿北京科技大学材料学硕328分求调剂 +6 1段时间 2026-03-31 7/350 2026-04-02 13:57 by 3041
[考研] 314求调剂 +11 1xiaojun23 2026-03-31 12/600 2026-04-02 12:31 by 1xiaojun23
[考研] 材料工程322分 +8 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 8/400 2026-04-02 11:53 by 3041
[考研] 材料调剂 +12 一样YWY 2026-04-01 12/600 2026-04-02 00:21 by 百秒光年
[考研] 省双一流重点一本大学招收调剂 +4 wwwwffffff 2026-03-31 7/350 2026-04-01 15:23 by wwwwffffff
[考研] 求调剂:一志愿:南京大学 专业:0705 总分320 ,本科985,四六级已过 +3 lfy760306 2026-03-31 3/150 2026-04-01 01:57 by Creta
[考研] 生物考研337分求调剂 +4 cgxin 2026-03-30 6/300 2026-03-31 14:18 by 记事本2026
信息提示
请填处理意见