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liuxiuaza

金虫 (正式写手)

[求助] 从琼脂糖凝胶中回收DNA

PCR扩增以后进行2%琼脂糖凝胶,切下340bp左右的目的片段后,如何回收DNA,希望有经验的虫子给点具体的建议
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生物-TJAB

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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几种PCR 产物回收的详方法和步骤

1) 普通胶回收

如果要胶回收,最好还是用试剂盒,方便,回收率也略高,实在要手工回收,可以切胶后加入3倍体积TE,水浴熔化后,酚、酚/氯仿抽提干净,乙醇沉淀即可。另外好像还有冷冻法,没作过,不是很清楚。

2) 从低熔点凝胶回收DNA

纯化DNA片段 加与凝胶体积相等的TE(10mmol/l Tris-HCl pH8.0,0.1mmol/l EDTA),置65℃水浴5分钟保温,使凝胶完全溶解。待放至室温,加等量酚(TE饱和,TE封在上层,取下层酚),轻轻混匀(不用混匀),12000rpm,3分钟离心。反复1-2次。取上层液,加0.1体积3mol/L醋酸钠(pH5.2)和2.5倍体积无水乙醇,进行乙醇沉淀。将纯化的DNA加适量TE溶解,测定含量,备用(可用于目的基因结构分析,探针制备等)。

3) 扩增特异性好的PCR回收

如果PCR扩增特异性好,只是简单的PCR产物纯化回收,可以在PCR产物中加入50ug/ml 的蛋白酶K,37度1h,酚/氯仿抽提一次,氯仿抽提一次,上清加入0.1体积的醋酸钠,2.5体积的无水乙醇沉淀回收。
14楼2012-08-18 19:37:47
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普通回帖

小qiang

铁杆木虫 (正式写手)

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liuxiuaza: 金币+5 2012-08-20 11:56:03
现在不是都用回收试剂盒吗?
2楼2012-08-17 16:40:37
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dshlove

木虫 (正式写手)

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liuxiuaza: 金币+5 2012-08-20 11:56:12
我只用过试剂盒。具体操作看试剂盒,首先你肯定得把胶融了,50度10分钟就可以了,剩下就是傍柱,漂洗,最后洗脱。
3楼2012-08-17 16:41:54
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

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liuxiuaza: 金币+5 2012-08-20 11:56:18
用试剂盒吧,我们用的是天根的,比较便宜,也挺好使得。
4楼2012-08-17 17:33:23
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烟涛微茫

铁杆木虫 (文坛精英)

卡牌大师

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liuxiuaza: 金币+5 2012-08-20 11:56:25
用回收试剂盒就可以回收DNA
心之所善,九死未悔
5楼2012-08-17 19:59:43
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M110899

金虫 (正式写手)

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liuxiuaza: 金币+5 2012-08-20 11:56:31
试剂盒回收,天根和Takara的都用过
6楼2012-08-17 20:07:18
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yesucao

木虫 (正式写手)

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liuxiuaza: 金币+5 2012-08-20 11:56:36
用试剂盒,好像小于500bp的片段还需要另外加异丙醇
7楼2012-08-17 21:59:34
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hutingting

银虫 (正式写手)

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liuxiuaza: 金币+10 2012-08-20 11:55:05
我们用的天根的试剂盒,从胶上切下目的片段,按说明书加3倍体积的溶胶液,50度温浴,直至胶完全溶解,转移至硅胶柱里,离心,漂洗液洗两边,空离一次,吹干乙醇,EB洗脱DNA。
8楼2012-08-18 09:09:25
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674515734

铜虫 (小有名气)

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先称胶的重量,然后融化,再按照试剂盒操作就可以刻,很简单
在卑微中活出精彩,在短暂中寻求永恒。。。
9楼2012-08-18 09:31:44
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zy晨曦

新虫 (小有名气)

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liuxiuaza: 金币+10 2012-08-20 11:55:25
使用回收试剂盒吧,按照说明书操作即可。2%的胶是不是浓度低了点儿
日事日毕,日清日高
10楼2012-08-18 10:22:05
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