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sherrysure银虫 (小有名气)
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[求助]
对于一个没有内含子的基因，请问用基因组或cDNA作为模板跑PCR对于结果有什么影响吗？
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请问大家， 对于一个没有内含子的基因，用基因组或cDNA作为模板跑PCR对于结果有什么影响吗？ 我在扩一个基因，用公布的mRNA序列设计的引物，文献上都是用反转录后的cDNA跑的PCR，但是我将这一序列到我所做的生物基因组中比对后发现其没有内含子，所以我就用它的基因组试着跑PCR，可是没有条带，不知道是什么原因。 还希望高手不吝赐教。 另外还想请问一下： 跑PCR的时候，什么时候用rTaq酶，什么时候用LA Taq酶？ 两者PCR对后续实验又影响吗？ 万分感激！ |
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sherrysure
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8楼2012-08-21 22:05:39
【答案】应助回帖
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| 基因与mRNA反转录到的DNA是不一样的，基因即使没有内含子，也会有基因转录的调控序列等，要比mRNA反转录得到的序列长，此外，初级转录产物还可能会被间接修饰等。所以不能用基因序列代替cDNA。 |
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sherrysure
2楼2012-08-16 17:45:56
sherrysure
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