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请教基因克隆问题
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taibai427
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[交流]
请教基因克隆问题
请问各位虫友,望赐教
对未知基因克隆的试验中,1.设计简并引物克隆保守区,扩增出来的结果会出现很多条带吗?如果有该怎么取舍?
2.想克隆的这个基因,只在亲缘关系非常远的物种中找到一条可参考序列,而且未经过功能验证,请问,基于目前的情况,用RACE技术能克隆出我想要的基因吗?如果不行,有没有其他的技术、方法克隆出这个基因呢
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2012-08-16 16:18:48
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mgangle
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2012-08-24 14:53:29
taibai427: 金币+1
2012-08-28 10:27:30
如果是亲缘关系较远,即使用通用引物一般也是很难扩增出所需条带的,建议先通过氨基酸序列找找有没有亲缘性较近的序列。如果没有,就多设计几对,出现多条带的情况下,最好是都进行克隆,然后通过序列比对来确定是否存在有自己所需的序列。
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2012-08-24 14:49:30
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taibai427
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不会吧
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2012-08-17 09:53:42
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2012-08-17 14:07:02
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2012-08-17 14:30:04
第一个问题
多设几对引物,多试几遍,看看你所设的引物在其他物种上扩出来的基因片段是多长,参照着来,如果亲缘关系比较近的话一般不会相差太远
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3楼
2012-08-17 12:16:12
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taojun
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2012-08-20 12:26:59
我建议你多设计几对引物,试试啊,换用不同物种的基因组试试,看看能否扩出来,然后比较!
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4楼
2012-08-19 14:03:18
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2012-08-19 15:18:29
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taibai427
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2012-08-24 11:00:07
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shytcb
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2012-08-28 10:27:33
可以用全基因合成,还能进行密码子优化。
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10楼
2012-08-24 14:57:55
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taibai427
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10楼
:
Originally posted by
shytcb
at 2012-08-24 14:57:55
可以用全基因合成,还能进行密码子优化。
这个怎么弄呢
? 有具体参考吗
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11楼
2012-08-28 10:26:48
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9楼
:
Originally posted by
mgangle
at 2012-08-24 14:49:30
如果是亲缘关系较远,即使用通用引物一般也是很难扩增出所需条带的,建议先通过氨基酸序列找找有没有亲缘性较近的序列。如果没有,就多设计几对,出现多条带的情况下,最好是都进行克隆,然后通过序列比对来确定是否 ...
目前NCBI上只有一个参考序列,还是未经过功能验证的, 不知道该怎么做
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12楼
2012-08-28 10:27:27
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shytcb
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全基因克隆和密码子优化需要送交公司完成!
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13楼
2012-08-29 10:15:22
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6楼
2012-08-19 16:42
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taibai427
7楼
2012-08-20 12:27
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