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guochuan104

新虫 (初入文坛)

[求助] 水体细菌总数和活菌数镜检

各位大虾好~小妹为环境专业小硕一枚,最近要做水体和植物根系微生物的分析,导师要求检测:水体游离微生物细菌总数、活细菌染色分析、显微分析鉴定群落特征这几个指标,周六就要去采样了,我只查到DAPI法测总菌,关于采样后的处理和镜检步骤一无所知。我们实验室配备的是ZEISS公司的AXIOSKOP 40\40FL,我从来没用过,实验室也没人做微生物,求各位给予详细指导,愈详细愈好~
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guochuan104

新虫 (初入文坛)

难道沉了?大家来帮帮忙啊!!!
2楼2012-08-02 13:47:57
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swnz

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我看到中科院南京土壤研究所编著的“土壤与环境微生物研究法”科学出版社出版。有比较完整的土壤微生物方法。
跟着感觉走
3楼2012-08-02 21:26:18
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guochuan104

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by swnz at 2012-08-02 21:26:18
我看到中科院南京土壤研究所编著的“土壤与环境微生物研究法”科学出版社出版。有比较完整的土壤微生物方法。

好吧,我争取去弄一本看看~
4楼2012-08-02 21:28:17
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michaelcyq

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
guochuan104: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-08-05 11:02:27
水中微生物生物量的测定方法一般包括:稀释培养计数,血球计数板计数,显微镜镜检,或其它间接方法(如磷脂法)等等。
LZ基本上确定了用显微镜法的话就是染色。
DAPI和其它一些染色剂(SYTO9)等能够染出总细菌数,但是无法指示细菌活性。
细菌活性显微镜检测可以采用复合染色法,常用的为SYTO9/PI,这样然出来的绿色(SYTO9)为活菌,红色(PI)为死菌。
不过lz想了解植物根系微生物的话可能简单镜检会碰到困难,因为上述染色剂基本针对细菌,而对于真菌(如内外生菌根真菌)的是否有效我也没有试过。

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5楼2012-08-03 21:24:00
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guochuan104

新虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by michaelcyq at 2012-08-03 21:24:00
水中微生物生物量的测定方法一般包括:稀释培养计数,血球计数板计数,显微镜镜检,或其它间接方法(如磷脂法)等等。
LZ基本上确定了用显微镜法的话就是染色。
DAPI和其它一些染色剂(SYTO9)等能够染出总细菌数 ...

我查了下Baclight试剂盒很贵,我可不可以用DAPI/PI染色,DAPI染总菌,PI染活菌呢?如果可以的话,具体操作上应该注意什么呢?有木有什么文献可以给我参考参考的?谢谢这位木虫~
6楼2012-08-05 09:01:23
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guochuan104

新虫 (初入文坛)

大家快来帮忙啊~拜谢~
7楼2012-08-05 11:04:16
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michaelcyq

铁杆木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
guochuan104: 金币+5, ★★★很有帮助, 你们是学生物的吧?真心膜拜~买Baclight的话我得和老师再商量下,看是否必要,头痛~ 2012-08-05 21:47:37
引用回帖:
6楼: Originally posted by guochuan104 at 2012-08-05 09:01:23
我查了下Baclight试剂盒很贵,我可不可以用DAPI/PI染色,DAPI染总菌,PI染活菌呢?如果可以的话,具体操作上应该注意什么呢?有木有什么文献可以给我参考参考的?谢谢这位木虫~...

SYTO9/PI复合染色的原理是:
1、死细胞细胞膜有破损;
2、SYTO9分子小,能够穿透健康细胞膜而和胞内DNA结合,在激光激发下发绿光;同时也能将死细胞染色;
3、PI分子大,只能染细胞膜破损的死细胞,而不能染健康细胞,在激光激发下发红光;
4、对于死细胞,PI分子能够优先于SYTO9结合DNA,因此死细胞多位红色,但是也存在SYTO9和PI同时染色而出现黄色的情况;
基于以上4点,syto9/PI复合染色能够区分死活细胞。
我没有见过用DAPI和PI复合染色的,没准儿是因为DAPI比PI更能和DNA结合使PI无法染上细胞(?不确定),因此不能用来指示死活?
文献很多,给你几个我们实验室自己做的吧。
Zhang T, Fang HHP. 2004. Quantification of Saccharomyces cerevisiae viability using BacLight. Biotechnology Letters. 26(12), 989-992
Xie XJ, Li YG, Zhang T, Fang HHP. 2006. Bacterial survival in evaporating deposited droplets on a teflon-coated surface. Applied Microbiology and Biotechnology. 73(3), 703-712
Chao Y, Zhang T. 2011. Probing roles of lipopolysaccharide, fimbria and colanic acid in the attachment of Escherichia coli strains on inert surfaces. Langmuir. 27, 11545-11553.
第一个可能对你来说有点启发,因为是用来看酵母死活的,说明真菌类的死活也许可以用这种方法判定。
8楼2012-08-05 17:22:47
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