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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 测序结果分析
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刁寒冰

银虫 (小有名气)

[交流] 测序结果分析

各位虫友们：
    PCR产物测序后，然后所得序列跟NCBI序列对比，结果有几个位置碱基突变，我想分析突变位点，在怎么做呢？是不是把所得序列翻译成氨基酸，在对比不同位置的呢？
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robert-RBT

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1楼 2012-08-01 16:02:59
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robert-RBT

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 刁寒冰 at 2012-08-02 13:19:09
在NCBI直接就可以比对编码氨基酸差异吗？我只会比对核酸blast，请问高人，怎么弄？...

用blastX看到的就是氨基酸差异
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6楼2012-08-02 19:07:47
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robert-RBT

木虫 (小有名气)
★
刁寒冰(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
不用那么麻烦，NCBI上就可以直接看出编码氨基酸的差异。分析差异是基于测序克隆准确的基础上才有意义。
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2楼2012-08-01 20:48:28
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刁寒冰

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by robert-RBT at 2012-08-01 20:48:28
不用那么麻烦，NCBI上就可以直接看出编码氨基酸的差异。分析差异是基于测序克隆准确的基础上才有意义。

在NCBI直接就可以比对编码氨基酸差异吗？我只会比对核酸blast，请问高人，怎么弄？
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3楼2012-08-02 13:19:09
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bioyujun

木虫 (正式写手)
★
刁寒冰(金币+1): 谢谢参与
去下载个vector NTI软件，或者geneious，alingnment一下！！
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4楼2012-08-02 15:27:32
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