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刁寒冰

银虫 (小有名气)


[交流] 测序结果分析

各位虫友们:
    PCR产物测序后,然后所得序列跟NCBI序列对比,结果有几个位置碱基突变,我想分析突变位点,在怎么做呢?是不是把所得序列翻译成氨基酸,在对比不同位置的呢?
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刁寒冰

银虫 (小有名气)


引用回帖:
6楼: Originally posted by robert-RBT at 2012-08-02 19:07:47
用blastX看到的就是氨基酸差异...

嗯,看到了 谢谢呵
11楼2012-08-04 10:39:20
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robert-RBT

木虫 (小有名气)



刁寒冰(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
不用那么麻烦,NCBI上就可以直接看出编码氨基酸的差异。分析差异是基于测序克隆准确的基础上才有意义。
2楼2012-08-01 20:48:28
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刁寒冰

银虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by robert-RBT at 2012-08-01 20:48:28
不用那么麻烦,NCBI上就可以直接看出编码氨基酸的差异。分析差异是基于测序克隆准确的基础上才有意义。

在NCBI直接就可以比对编码氨基酸差异吗?我只会比对核酸blast,请问高人,怎么弄?
3楼2012-08-02 13:19:09
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bioyujun

木虫 (正式写手)



刁寒冰(金币+1): 谢谢参与
去下载个vector NTI软件,或者geneious,alingnment一下!!
4楼2012-08-02 15:27:32
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