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xiaojo

新虫 (初入文坛)

[求助] PAGE胶回收的具体步骤

各位前辈,有没有人做过PAGE胶回收啊?我要回收甲基化的片段,已经从胶上挖了几十个条带了,放在1.5ml的离心管里,-20℃冰箱。现在要做回收了,有如下问题:
    1.PAGE的条带挖出来能放在-20℃冰箱吗?一般能存放多久?
    2.回收之后还要跑PCR,要使DNA溶解出来具体怎样处理?是加TE溶解再60℃水浴1小时吗?一般加多少TE合适?
    3.水浴后离心要取上清跑PCR,但是一般就是取几微升,那剩下的DNA要如何保存呢?
   还请各位前辈多多指点,这三伏天在实验室跑大板子不容易啊~
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xiaojo

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
12楼: Originally posted by tjhyf2012 at 2014-01-13 22:31:01
是啊,今天试了一下亚甲基蓝染色,但是效果不是很好,条带和背景分不太清楚,以后可以试试银染。请问银染之后的脱色步骤和蛋白电泳一样么?...

我没有做过蛋白电泳哎。把我银染的方法发给你,因为我做的是大板子,你的玻璃板要是小的话可以相应比例的减少量。
仪器和设备:
四个塑料方盒(比玻璃板面积稍大),2个2L的烧杯,摇床
试剂的准备:
固定液:200ml乙醇,10ml冰醋酸,加水至2L
染色液:4g AgNO3至2L蒸馏水中
显色液:把30g NaOH 溶于2L蒸馏水中,在使用前几分钟,加入终浓度为0.4%的甲醛溶液。
染色过程:
1.        固定:将附着凝胶的玻璃板放入固定液中,置于摇床上振荡约5min;
2.        染色:将玻璃板放入准备好的装有染色液的塑料盒中,放在摇床上振荡,染色8-12min;
3.        漂洗:将玻璃板放入蒸馏水中,漂洗1-2min,取出玻璃板,稍稍沥干;
4.        显色:在漂洗将要结束时,将20ml 37%甲醛加入准备好的NaOH溶液中,混匀后,将玻璃板置于显色液中,轻轻摇动,至条带完全清晰;
5.        晾干,拍照或者扫描保存。
13楼2014-01-14 16:48:56
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普通回帖

tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-20 13:48:11
把条带切下来,加TE,尽量弄碎,下面三种方法选一种做
1.60℃水浴1h
2.4℃过夜
3.-20℃,4℃反复冻融三次,每次1h
PCR的时候取1μL作为模板。
te加入30ul就可以了,一般看你切胶的大小。
dna放te中就可以了。

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coasttocoast。
2楼2012-07-20 10:51:50
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xiaojo

新虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-20 10:51:50
把条带切下来,加TE,尽量弄碎,下面三种方法选一种做
1.60℃水浴1h
2.4℃过夜
3.-20℃,4℃反复冻融三次,每次1h
PCR的时候取1μL作为模板。
te加入30ul就可以了,一般看你切胶的大小。
dna放te中就可以了。

非常感谢啊!!
我还有个疑问啊。就是用TE溶解胶之后,离心,是把上清都取出来,转移到新的离心管里吗?剩下的胶就可以扔了是吗?还是可以取胶的一部分用来溶解,剩下的可以保存。一般胶放-20℃能放置多久啊?
我的问题有点多,呵呵~~
3楼2012-07-20 11:00:57
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jl860822

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你可以上网去查一下这篇文献:一种从聚丙烯酰胺凝胶上回收DNA片段的简易方法,对你可能会有帮助的

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2012-07-20 11:17:51
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ranger04

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-20 13:48:24
分子克隆3上有详细的protocol。简答来说就是把胶切小(不能切碎。离心不下去)用(NH4)Ac溶液重悬,振荡过夜将DNA扩散出来,再用乙醇沉淀DNA。祝顺利

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2012-07-20 11:18:34
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaojo at 2012-07-20 11:00:57
非常感谢啊!!
我还有个疑问啊。就是用TE溶解胶之后,离心,是把上清都取出来,转移到新的离心管里吗?剩下的胶就可以扔了是吗?还是可以取胶的一部分用来溶解,剩下的可以保存。一般胶放-20℃能放置多久啊?
我 ...

可以转移的,剩下的也冻存起来,以防万一吗。冻存起来放置的时间半年没问题。
coasttocoast。
6楼2012-07-20 11:36:15
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xiaojo

新虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-20 11:17:51
你可以上网去查一下这篇文献:一种从聚丙烯酰胺凝胶上回收DNA片段的简易方法,对你可能会有帮助的

已经下载了这篇文献,真的很有帮助,谢谢啊!
7楼2012-07-20 15:26:46
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xiaojo

新虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by ranger04 at 2012-07-20 11:18:34
分子克隆3上有详细的protocol。简答来说就是把胶切小(不能切碎。离心不下去)用(NH4)Ac溶液重悬,振荡过夜将DNA扩散出来,再用乙醇沉淀DNA。祝顺利

分子克隆实验指南第三版,我有呢,在哪页啊?我之前没找着呢。
8楼2012-07-20 15:28:51
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xiaojo

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-20 11:36:15
可以转移的,剩下的也冻存起来,以防万一吗。冻存起来放置的时间半年没问题。...

啊。那我就放心了,我还怕给冻坏了呢。呵呵,谢谢前辈!
9楼2012-07-20 15:29:43
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tjhyf2012

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tupac225 at 2012-07-20 10:51:50
把条带切下来,加TE,尽量弄碎,下面三种方法选一种做
1.60℃水浴1h
2.4℃过夜
3.-20℃,4℃反复冻融三次,每次1h
PCR的时候取1μL作为模板。
te加入30ul就可以了,一般看你切胶的大小。
dna放te中就可以了。

谢谢楼主,再请教一个问题,这个种回收方法,是用哪种染色可以呢?银染还是亚甲蓝染色?
10楼2014-01-10 21:46:35
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