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soffy0214

铜虫 (小有名气)

[求助] 今天提了一天的RNA,结果在紫外下只看到一团黑色。求分析!

我很确定我的rna是提出来了的。我用甲醛变性胶,加2微升EB,胶是红色的。然后加10微升样电泳,样中加4微升甲醛,2微升上样缓冲液,2微升10倍的MOPS缓冲液。检测时什么都看不见,只在溴酚蓝的位置看到一团黑色的东西。A260和A280都是负值。我的RNA哪去了?求解!

[ Last edited by soffy0214 on 2012-7-19 at 08:24 ]
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

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小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-19 15:18:46
A260,280以及A260/280比值都可以用于分析RNA纯度。你的值都是负的,说明RNA降解了或没有提出来。你提出的白色沉淀有可能只是组蛋白,一般提出RNA应该是胶状和管差不多颜色而非白色沉淀,或者你获得的RNA量太多和部分蛋白沉淀在一起形成白色物,但是从你的A260,280值来看,是没有提出来。白色的应该是组蛋白,因为组蛋白溶解于水和稀酸。
6楼2012-07-19 10:09:10
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-20 13:39:39
其实我觉得降解的可能比较大,提多少肯定都能提出来。实验前,请问RNase AWAY把实验台等擦拭干净,操作过程中,每步也注意一下应该问题不大啊,只有再做一次看。实在不行找个你的师兄师姐的带你一起做一次。
8楼2012-07-19 16:32:40
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-07-20 13:40:02
不一定,如果提出的RNA量不大而降解厉害的话有可能带跑不出来,这个是正常的,今天我还测试了一下,提完RNA后测浓度,用NANODROP,如果点上样,马上点测浓度,浓度是250ng/ul, 如果延迟10秒后再扣上测量杆再测,浓度就是220ng/ul。
11楼2012-07-19 20:07:23
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