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soffy0214

铜虫 (小有名气)

[求助] 今天提了一天的RNA,结果在紫外下只看到一团黑色。求分析!

我很确定我的rna是提出来了的。我用甲醛变性胶,加2微升EB,胶是红色的。然后加10微升样电泳,样中加4微升甲醛,2微升上样缓冲液,2微升10倍的MOPS缓冲液。检测时什么都看不见,只在溴酚蓝的位置看到一团黑色的东西。A260和A280都是负值。我的RNA哪去了?求解!

[ Last edited by soffy0214 on 2012-7-19 at 08:24 ]
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上帝关上一扇门,就会打开一扇窗。
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-19 15:18:46
A260,280以及A260/280比值都可以用于分析RNA纯度。你的值都是负的,说明RNA降解了或没有提出来。你提出的白色沉淀有可能只是组蛋白,一般提出RNA应该是胶状和管差不多颜色而非白色沉淀,或者你获得的RNA量太多和部分蛋白沉淀在一起形成白色物,但是从你的A260,280值来看,是没有提出来。白色的应该是组蛋白,因为组蛋白溶解于水和稀酸。
6楼2012-07-19 10:09:10
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jl860822

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你怎么确定你的RNA一定提出来了呢?然后就是你的跑胶条件是多少?
2楼2012-07-19 08:38:47
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soffy0214

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-19 08:38:47
你怎么确定你的RNA一定提出来了呢?然后就是你的跑胶条件是多少?

因为有一团白色沉淀啊。加50微升的DEPC水后就溶解了。我使用trizol提的。60V,30min
上帝关上一扇门,就会打开一扇窗。
3楼2012-07-19 09:42:57
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soffy0214

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-19 08:38:47
你怎么确定你的RNA一定提出来了呢?然后就是你的跑胶条件是多少?

即使是降解了,也不该没有任何痕迹啊。
上帝关上一扇门,就会打开一扇窗。
4楼2012-07-19 09:44:57
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