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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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西交-flx

新虫 (初入文坛)

[求助] 连接产物双酶切

请教各位大侠:
      近期做基因和真核表达载体连接实验已有个把个月,由于真核表达载体用的是pEGFP-N1,大小有4.7bp,插入的载体有2.4bp,分子量过大,导致很难连接上,重复做了四五周期连接实验;最近一次的连接产物跑胶出来三条带,貌似连接上了,之后把连接产物双酶切,跑胶显示两条带,且分子量一个为载体分子量,另一个为插入片段分子量,初步验证连接上,故送菌液去测序,但是测序结果出来只有载体的信息无任何插入基因的信息,显示好像没连接上,近期实验做的焦头烂额的,想请教大家原因,小女不胜感激~~~
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  • 附件 1 : 双酶切跑胶.bmp
  • 2012-07-17 10:58:35, 433.05 K

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西交-flx

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by reallpf at 2012-07-18 08:35:58
你拿连接产物去双酶切,不管连上与否结果不都应该是两个条带,一个载体,一个目标片段吧。所以个人认为你的验证方式就不严谨,仅仅凭这一点就拿去送测序,结果五花八门很正常。前面的实验不设计好,后面出问题了分析 ...

l连接产物做双酶切有两种结果呀,如果片段和载体连接上了就会酶切出各自分子量的条带,如果没有连接上,但是又长斑了,而且也提出了质粒,就说明载体自连了,酶切时不会出现两个条带,只会出现载体分子量的条带。
之前每步实验都是经过跑胶验证的,先把目的片段扩增出来,胶回收,再分别双酶切目地片段和载体,使带有相同的粘性末端,然后分别胶回收,验证浓度比在1:5---1:10 之间后进行10 ul 的连接实验,之后转化,挑斑,摇菌,提质粒,菌液pcr验证和双酶切验证,都是阳性结果,而且双酶切条带刚好是载体和片段分子量,故才送去测序。
10楼2012-07-18 09:13:26
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西交-flx

新虫 (初入文坛)

附件的最右边是DL2000的marker,从左到右依次是1到10 号,送了1,5,9号三管去测序的,结果都一样没连接上。
2楼2012-07-17 11:26:45
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+5, 鼓励发帖帮助解答问题。 2012-07-17 21:01:06
amisking: 回帖置顶 2012-07-17 21:01:08
你的maker是DL2000的marker吗?最好用1kb的ladder跑,这样看不清楚.
先确定你的载体上没有你引物上的酶切位点,如果载体上有你引物上的位点,那么你双酶切检验的时候,很难分清楚是不是你要的目的片段.这个确定之后,连接转化之后,先菌液pcr,然后双酶切,最好送质粒过去测序,多送几个.
coasttocoast。
3楼2012-07-17 11:33:41
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tianyinghu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-07-18 13:49:11
pEGFP-N1,大小有4.7kp,插入的载体有2.4kp,说实在的片段一点也不大,这个载体我经常用,比较好连接的,从你电泳的图很容易看出问题:
    载体建议你加到150ng,你的图上直接看出载体加的太多了,不知道你板长的怎么样,片段随便你怎么加,必定片段比较大,一般DL2000的MK最上面的2KB条带是50ng每ul,所以你的载体估计都加到500ng以上了,还有连接后不用跑胶检查,直接转化就可以,严谨点的做个载体空白对照。然后做菌落PCR简单,再送测序。一般连接产物跑胶是显现湖装的,就想往上的拖尾PCR一样。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2012-07-17 15:31:59
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