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西交-flx

新虫 (初入文坛)

[求助] 连接产物双酶切

请教各位大侠:
      近期做基因和真核表达载体连接实验已有个把个月,由于真核表达载体用的是pEGFP-N1,大小有4.7bp,插入的载体有2.4bp,分子量过大,导致很难连接上,重复做了四五周期连接实验;最近一次的连接产物跑胶出来三条带,貌似连接上了,之后把连接产物双酶切,跑胶显示两条带,且分子量一个为载体分子量,另一个为插入片段分子量,初步验证连接上,故送菌液去测序,但是测序结果出来只有载体的信息无任何插入基因的信息,显示好像没连接上,近期实验做的焦头烂额的,想请教大家原因,小女不胜感激~~~
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  • 附件 1 : 双酶切跑胶.bmp
  • 2012-07-17 10:58:35, 433.05 K

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西交-flx

新虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by tianyinghu at 2012-07-17 15:31:59
pEGFP-N1,大小有4.7kp,插入的载体有2.4kp,说实在的片段一点也不大,这个载体我经常用,比较好连接的,从你电泳的图很容易看出问题:
    载体建议你加到150ng,你的图上直接看出载体加的太多了,不知道你板长的怎 ...

DL2000的marker我上了 5 ul,按理来说,5 ul的量2KB处条带应该是50 ng。我当时把插入基因和载体分别双酶切回收后,分别上了5 ul 跑了胶,插入基因条带亮度远远高于载体的亮度,把他们连接体系的比例调到1:5左右才进行的连接实验,连接完做了菌液pcr,提取质粒后做了双酶切,都是阳性结果的,一般来说双酶切是比较准确的,很少出现假阳性,但是我的结果,连接质粒双酶切切出了正确条带,为什么测序结果显示没连接上呢???
5楼2012-07-17 16:37:31
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西交-flx

新虫 (初入文坛)

附件的最右边是DL2000的marker,从左到右依次是1到10 号,送了1,5,9号三管去测序的,结果都一样没连接上。
2楼2012-07-17 11:26:45
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+5, 鼓励发帖帮助解答问题。 2012-07-17 21:01:06
amisking: 回帖置顶 2012-07-17 21:01:08
你的maker是DL2000的marker吗?最好用1kb的ladder跑,这样看不清楚.
先确定你的载体上没有你引物上的酶切位点,如果载体上有你引物上的位点,那么你双酶切检验的时候,很难分清楚是不是你要的目的片段.这个确定之后,连接转化之后,先菌液pcr,然后双酶切,最好送质粒过去测序,多送几个.
coasttocoast。
3楼2012-07-17 11:33:41
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tianyinghu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-07-18 13:49:11
pEGFP-N1,大小有4.7kp,插入的载体有2.4kp,说实在的片段一点也不大,这个载体我经常用,比较好连接的,从你电泳的图很容易看出问题:
    载体建议你加到150ng,你的图上直接看出载体加的太多了,不知道你板长的怎么样,片段随便你怎么加,必定片段比较大,一般DL2000的MK最上面的2KB条带是50ng每ul,所以你的载体估计都加到500ng以上了,还有连接后不用跑胶检查,直接转化就可以,严谨点的做个载体空白对照。然后做菌落PCR简单,再送测序。一般连接产物跑胶是显现湖装的,就想往上的拖尾PCR一样。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2012-07-17 15:31:59
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