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如何判断我的5'RACE已经克隆到基因N端全长了
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目前在用SMart-RACE 克隆基因，请各位大虾帮小妹分析一下下面两个序列是否已经拿到了N端全长了。加粗的地方是Smart NUP引物序列，下划线的是我推测的ATG。但是用该序列去NCBI上做Blastx，发现与别的物种这类基因的N端相比，相差十个左右的氨基酸。所以比较谜惑到底我是否拿到了这类基因的全长。请大虾们赐教。。。。 AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACGCGGGGATGCGAACTTGTAACGTTTAACTTGTTATCGCCTTTCATCAAATACTAAAAACATGTCTTTTTCTTCATCTCATTCAACCCTTCACCATAACATAAGTCTTAAGCAAGCCGTCATTCGAAATACGGTGAAGCTGAATCCTAGCATTTGGGGAGATCAGTTTCTCACGTATAATGAGAGAAAGGAGCAAGCTTGTGAGAAGCAACGGGCTAAGGAACTAAAAGAGAAAGTGCAAAAAGAGCTAGTGATTGATGGATCAATGGAACCTACACAACATATGAAGTTATTGGAACTTATTGATGCGATCCAACGTCTGGGAGTAGCGTATCATTTTGAAGATGAAATCGAGGAATGCTTAACGCGTATTTATGTTACTTATGGGGATAAATGGATCAACG AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACGCGGGGTATCAATATCTGTCTCTCTTTCTAAAATCACACAGCTATTTTCCCCAAGTATGGCAATTAACAATTGTGTTAAACCACAAGACATTCAAACTACCCCAATTCAAGAAGAAGATTTTGTTGCAAATGGCACAAGCAAGAAGAAAGAAGTATCCATCAAAGATTCTGAACAATCAGAAGAAGTCCGAAATCTTCTTAAGAATGATCCTTTCAAAACCTTGGAAACAGTTGACGCTCTCCAGAAACTTTGCGTCAACCATTACTTTCAGGAGGAGATCAACTCGATATTGAAAACGCTTTACACAAGAATGTATGACAATAGTCATGGCCAAAGTCTTTACGACGTTTCCCTCTATTTTCGAATCCTTCGTCAAGAAGGTTACTATGTATCAGCTGATGTCTTTGCAAACTTCAAAGAAAAAGATGGCAAGTTCAAGGGAGATATAGCACAA |
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yinzqllll
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