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zhongyunxia新虫 (小有名气)
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gromacs能做到么?
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请教大家一个问题,看传热方面文献:文献写到:we heat the nanotube instantaneously to 500 K by rescaling the velocities of carbon atoms in the nanotube, and the system is then allowed to relax without a thermostat。文献没说明是用什么软件做的。在此,请教大家几个个问题:by rescaling the velocities of carbon atoms in the nanotube是怎么做的?我是在position restraint 中设置不同温度,使cnt的温度达到指定的500k,不知道对不对?第二个问题:relax without a thermostat ,是在mdp文件中把 Tcoulp=no吗? 还是 Tcoupl = no tau_t = 0.1 0.1 tc_grps = cnt pa ref_t = 500 323 第三个问题:gromacs能像lampps那样指定增加或移除能量吗?能实现么? 三个问题,谢谢大家了,感激不尽!!! |
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