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huangzhenjie

新虫 (初入文坛)

[求助] 酵母RNA提取问题

最近连续几次提了酿酒酵母的RNA(用液氮研磨, ambion 和roche的TRIzol 提),为什么电泳跑出来有四、五条条带(见下图)。到底哪三条才是RNA?其他的条带都是DNA污染吗?这样的能用来做反转录和QPCR吗?急需帮助,谢谢各位!

rna
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dhmdddd

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 金币+1, 鼓励应助 2012-05-29 18:51:40
上面两条是DNA污染,这样的话不建议进行下一步实验,你可以去一下DNA再往后面做
上班族,学习ing……
2楼2012-05-29 08:37:01
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huangzhenjie

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dhmdddd at 2012-05-29 08:37:01
上面两条是DNA污染,这样的话不建议进行下一步实验,你可以去一下DNA再往后面做

嗯,那请问加DNase I (RNase free)去DNA的具体步骤是怎样的,好像最后要加EDTA终止反应,那EDTA对后面的反转录酶没影响吗?谢谢!
3楼2012-05-29 15:40:19
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dhmdddd

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by huangzhenjie at 2012-05-29 15:40:19
嗯,那请问加DNase I (RNase free)去DNA的具体步骤是怎样的,好像最后要加EDTA终止反应,那EDTA对后面的反转录酶没影响吗?谢谢!...

你买的酶会有使用说明,不同公司的酶应该不一样吧,我们用的宝公司的酶,后面也是用的EDTA终止反应,对后面的反转录没有影响。
上班族,学习ing……
4楼2012-06-01 16:35:36
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longrna

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dhmdddd at 2012-05-29 08:37:01
上面两条是DNA污染,这样的话不建议进行下一步实验,你可以去一下DNA再往后面做

不会吧?ambion或Roche的试剂有这么差吗?虽然没用过这两家国际知名公司的Trizol,但我觉得不至于提出那么多的DNA。除非楼主非常违规操作。
建议楼主咨询该公司技术支持。
伟大航线....
5楼2012-06-02 10:26:57
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huangzhenjie

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dhmdddd at 2012-06-01 16:35:36
你买的酶会有使用说明,不同公司的酶应该不一样吧,我们用的宝公司的酶,后面也是用的EDTA终止反应,对后面的反转录没有影响。...

嗯,谢谢,我用fermentas 的,EDTA终止反应后,我没回收,拿去反转了,也行。
6楼2012-06-07 11:58:05
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huangzhenjie

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by longrna at 2012-06-02 10:26:57
不会吧?ambion或Roche的试剂有这么差吗?虽然没用过这两家国际知名公司的Trizol,但我觉得不至于提出那么多的DNA。除非楼主非常违规操作。
建议楼主咨询该公司技术支持。...

嗯,谢谢,不知道是不是 抽提完取上清时(取了400ul,)导致的DNA污染。我会再提看看。
7楼2012-06-07 12:03:30
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longrna

新虫 (正式写手)

其实,究竟是不是DNA仍有待证明吧
伟大航线....
8楼2012-06-07 18:12:48
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xpb2005

银虫 (小有名气)

(急)
想请教楼主,酵母的RNA提取你用液氮研磨法,是在研钵中研磨吗?还是在其他容器中研磨,您怎么做的,恳请您说的具体点,另外,你收集多少ml菌体来做呢?我也想提取酵母的RNA,提了2次都没有成功,用的是sigma的triozl,我是直接收集菌体后加triozl做的,会不会是酵母细胞壁没破除导致实验不成功,恳请楼主分享经验。谢谢您,祝您试验顺利。
9楼2012-07-23 21:48:17
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nxf121431

新虫 (初入文坛)

我想问一下 我现在用浓盐法提取酵母的rna 摇瓶培养要养多久啊
10楼2016-03-22 18:22:37
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