24小时热门版块排行榜    

查看: 2654  |  回复: 8

番薯素人

新虫 (小有名气)

[交流] 质粒酶切切不动,质粒在宿主中繁衍酶切位点会突变么? 已有5人参与

大家好!我的实验遇到了点困难,在此向大家求助!
我打算用质粒pMG36e做表达,其多克隆位点有HindIII、SacI这两个酶切位点,我就打算用这两个酶切位点。第一采用的双酶切质粒,连接目的片段,转化后发现全部是载体自连。于是我就用这两个没分别酶切了质粒,结果发现HindIII能切开质粒成线性,而SacI则几乎没有效果,不是酶活力低的问题。实验室的SacI是新买的,TAKARA产品,我又用SacI酶切了其他的含有这个酶切位点的质粒,比如pUC19,酶切效果很好,排除了酶的问题。后来我又试了EroRI、NheI酶切质粒,都能切开,基本也排除了质粒提取不纯之类的因素干扰。我不明白为什么单独SacI切不开。之前我师兄师姐们是用过这两个酶切位点在pMG36e上做表达的,有成功的先例。难道是质粒在宿主中传代的次数多了,酶切位点的碱基发生了突变?请问有这种可能吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

madengyu

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-21 13:39:22
本帖内容被屏蔽

2楼2012-05-20 20:54:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lwq652

木虫 (正式写手)

甲基化
一念错,便觉百行皆非,防之当如渡海浮囊,勿容一针之罅漏
3楼2012-05-20 22:50:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

番薯素人

新虫 (小有名气)

谢谢二位的建议,不过takara的SacI是不受甲基化影响的呀!我现在从实验室原来保存的菌株里从新提取的质粒,能切开了。不过之前的实验还是很诡异。有人建议我去做质粒测序,我觉得好像不太值当的。。。。。
4楼2012-05-22 18:10:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chibang1220

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
酶切连接后你的酶切位点附近序列会改变,还有就是扩增过程存在甲基化的可能。原因有很多种可能
人的差别在于业余时间
5楼2012-05-22 19:01:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by madengyu at 2012-05-20 20:54:11:
跟我前两天做的一样,我是用Not1切的,也是TAKARA的酶。经请教可能是GC甲基化严重所致,请问楼主:你所用的质粒pMG36e是保存在DH5α菌中的吗?要是那样的话,换一下JM系列的感受态重新转化一下,JM系列的感受态不会

我想请教一下:
按NEB的说明书上来看 楼主所用SacI和您所用的NotI均对Dam Dcm 以及CpG三种甲基化方式是不敏感的 虽然NEB并没有说此说明是绝对性的 但是我想应该不是甲基化的原因 所以想知道您的结果是最后换了JM系列而改善了吗?
还请赐教 我很好奇
Let God do with it as He wills
6楼2012-05-22 21:29:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

madengyu

禁虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

7楼2012-05-23 12:48:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by madengyu at 2012-05-23 12:48:59:
是JM110感受态。我从DH5α提的质粒切不开,但从JM109中提的质粒能切开。而Not1是易受GC甲基化影响的,所以有专家建议采用JM110感受态,把质粒转化进去,再提质粒酶切试试。我这几天找了找JM110感受态,在北京太难找

嘿嘿 不敢不敢
       我对这方面不是很懂 想请教一下 昨天眼拙 没有仔细看到NotI确实被高等真核生物DNA的某系组织特异以及时序调控下的甲基化(CpG形式)完全阻断 这样的话正如您所说 应该换不同株系
       但DH5a和JM110系列的关于甲基化的差距是在 DH5a是Dam/Dcm株系而JM110是dam-/dcm-株系 而NotI有对这两种甲基化方式则完全不敏感
       所以我想可能在于两个株系有对外源DNA的去甲基化方式有差异 但我在两者的基因型上不知道是哪个基因有这方面的作用
       还是我把某些概念搞混了 不是做这个的 很不懂但很感兴趣 希望能高手赐教
Let God do with it as He wills
8楼2012-05-23 13:25:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

意孤城_

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
酶切位点甲基化了,建议从新够载体,转化的时候使用特殊的去甲基化感受态细胞会避免这种情况
9楼2013-05-03 16:20:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 番薯素人 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 0XLacIJUOj8D 2026-08-24 8/400 2026-08-25 05:12 by BZKMTicpDhFj
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +7 scalable 2026-08-24 7/350 2026-08-24 23:01 by anata1209
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +7 图啦图啦 2026-08-24 8/400 2026-08-24 22:00 by maomao_da
[论文投稿] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 0XLacIJUOj8D 2026-08-24 3/150 2026-08-24 21:59 by BZKMTicpDhFj
[基金申请] 我面上完蛋了 +9 且听虎啸 2026-08-20 10/500 2026-08-24 20:08 by 苦寒来香
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 19/950 2026-08-24 16:52 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 17/850 2026-08-24 10:20 by echo8914667
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见