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番薯素人

新虫 (小有名气)

[交流] 质粒酶切切不动,质粒在宿主中繁衍酶切位点会突变么? 已有5人参与

大家好!我的实验遇到了点困难,在此向大家求助!
我打算用质粒pMG36e做表达,其多克隆位点有HindIII、SacI这两个酶切位点,我就打算用这两个酶切位点。第一采用的双酶切质粒,连接目的片段,转化后发现全部是载体自连。于是我就用这两个没分别酶切了质粒,结果发现HindIII能切开质粒成线性,而SacI则几乎没有效果,不是酶活力低的问题。实验室的SacI是新买的,TAKARA产品,我又用SacI酶切了其他的含有这个酶切位点的质粒,比如pUC19,酶切效果很好,排除了酶的问题。后来我又试了EroRI、NheI酶切质粒,都能切开,基本也排除了质粒提取不纯之类的因素干扰。我不明白为什么单独SacI切不开。之前我师兄师姐们是用过这两个酶切位点在pMG36e上做表达的,有成功的先例。难道是质粒在宿主中传代的次数多了,酶切位点的碱基发生了突变?请问有这种可能吗?
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by madengyu at 2012-05-20 20:54:11:
跟我前两天做的一样,我是用Not1切的,也是TAKARA的酶。经请教可能是GC甲基化严重所致,请问楼主:你所用的质粒pMG36e是保存在DH5α菌中的吗?要是那样的话,换一下JM系列的感受态重新转化一下,JM系列的感受态不会

我想请教一下:
按NEB的说明书上来看 楼主所用SacI和您所用的NotI均对Dam Dcm 以及CpG三种甲基化方式是不敏感的 虽然NEB并没有说此说明是绝对性的 但是我想应该不是甲基化的原因 所以想知道您的结果是最后换了JM系列而改善了吗?
还请赐教 我很好奇
Let God do with it as He wills
6楼2012-05-22 21:29:14
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madengyu

禁虫 (小有名气)

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-21 13:39:22
本帖内容被屏蔽

2楼2012-05-20 20:54:11
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番薯素人

新虫 (小有名气)

谢谢二位的建议,不过takara的SacI是不受甲基化影响的呀!我现在从实验室原来保存的菌株里从新提取的质粒,能切开了。不过之前的实验还是很诡异。有人建议我去做质粒测序,我觉得好像不太值当的。。。。。
4楼2012-05-22 18:10:31
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chibang1220

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
酶切连接后你的酶切位点附近序列会改变,还有就是扩增过程存在甲基化的可能。原因有很多种可能
人的差别在于业余时间
5楼2012-05-22 19:01:39
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