应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs中如何使用Buckingham势能参数
汕头大学海洋科学接受调剂
51/1返回列表
查看: 1696  |  回复: 13
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)

[求助] gromacs中如何使用Buckingham势能参数

哪位童鞋在gromacs中用过Buckingham势能的形式？文献给出了Buckingham势能的参数，可是gromacs中的势能参数皆默认采用的LJ形式的，不懂怎么弄，难道要把Buckingham函数形式拟合成LJ函数形式求得LJ参数？这样误差会不会太大啊？求指点！！！谢谢哈~~~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
最低奋斗目标：农夫，山泉，有点田~~~
1楼 2012-05-13 22:46:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by visualization at 2012-05-15 15:15:08:
可以。有的文献里报道水用LJ势表示，其他分子用Buckingham势能

哦哦，不过混用的话感觉好奇怪啊，Buckingham是ABC,LJ是sigma与epsilon，怎么用混合规则啊？！
赞一下 回复此楼
最低奋斗目标：农夫，山泉，有点田~~~
9楼2012-05-16 08:26:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 回帖置顶 2012-05-14 09:39:11
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-05-14 10:38:09
请阅读手册（我看的是4.5.4版本）
124页和129页内容
你一看便知
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

上善若水-川
2楼2012-05-14 09:37:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

上善若水-川

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-05-14 09:37:01:
请阅读手册（我看的是4.5.4版本）
124页和129页内容
你一看便知

61/56/1108016_1336959449_995.jpg
61/56/1108016_1336959449_276.jpg

可是Buckingham里面的参数形式都是有三个的，而gromacs力场里面添加的只有sigma和epsilon，没有Buckingham里面的A，B，C，那这三个参数添加到哪里啊？跪求指点~
赞一下 回复此楼
最低奋斗目标：农夫，山泉，有点田~~~
3楼2012-05-14 21:28:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
上善若水-川: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-05-14 21:52:56
引用回帖:
3楼: Originally posted by 上善若水-川 at 2012-05-14 21:28:09:
可是Buckingham里面的参数形式都是有三个的，而gromacs力场里面添加的只有sigma和epsilon，没有Buckingham里面的A，B，C，那这三个参数添加到哪里啊？跪求指点~
a8/0a/1411646_1337002071_244.jpg



请仔细看手册内容，
还得自己多多体会
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

上善若水-川
4楼2012-05-14 21:42:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 105500药学求调剂 +3 x_skys 2026-04-12 3/150 2026-04-14 10:26 by lifeisbrave
[考研] 08工学 309分求调剂 +9 Yin DY 2026-04-08 9/450 2026-04-14 09:10 by dick_runner
[考研] 生物学308求调剂 +6 相信必会光芒万� 2026-04-11 6/300 2026-04-14 08:57 by licg0208
[考研] 085600材料与化工，求调剂 +14 won_qii 2026-04-07 14/700 2026-04-13 22:21 by pies112
[考研] 297工科，求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 化工学硕 285求调剂 +29 Wisjxn 2026-04-07 29/1450 2026-04-13 13:47 by floriea
[考研] 材料考研调剂 +29 云木达达 2026-04-11 31/1550 2026-04-13 13:32 by lyh鲁老师
[考研] 0854调剂 +10 长弓傲 2026-04-11 11/550 2026-04-13 10:38 by wp06
[考研] 考研二轮调剂 +10 故人?? 2026-04-09 10/500 2026-04-13 09:55 by szhize
[考研] 291求调剂 +8 关忆北. 2026-04-11 8/400 2026-04-12 09:32 by 逆水乘风
[考研] 电子信息279求调剂，有书读就行 +8 wwwooden 2026-04-08 11/550 2026-04-11 20:22 by cq2548
[考研] 311求调剂 +13 xyp想读书 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:41 by 猪会飞
[考研] 263能源动力专硕求调剂 +3 加大号饭盒袋 2026-04-10 3/150 2026-04-10 22:23 by 286640313
[考研] 计算机类求调剂，22408-274分 +7 上岸de小虫 2026-04-09 8/400 2026-04-10 19:56 by fxue1114
[考研] 071000生物学调剂求助 +17 zzzzwww 2026-04-09 20/1000 2026-04-10 15:55 by 求调剂zz
[考研] 已调剂 +18 柴郡猫_ 2026-04-09 19/950 2026-04-09 22:10 by 柴郡猫_
[考研] 311求调剂 +6 surte 2026-04-08 13/650 2026-04-09 14:00 by surte
[考研] 086000生物与医药调剂 +7 awwwwwooooo 2026-04-09 7/350 2026-04-09 13:31 by 北极159263
[考研] 求调剂 +3 猪肉墩粉条cc 2026-04-08 4/200 2026-04-09 10:05 by 猪肉墩粉条cc
[考研] 求调剂 +13 柒luck 2026-04-07 13/650 2026-04-08 22:46 by 猪会飞
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭