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zhxiaofa

新虫 (初入文坛)

[求助] 想知道某种微生物代谢产物的产生基因并对该基因进行研究,该如何操作?论文也行

现在已知某种微生物能产生某种代谢产物,想知道是什么基因指导该产物的合成,找出参与调控的基因。并对相关基因进行一些研究。想知道该如何操作,试验方法是什么?代谢产物不限,重要的是研究方法,有相关的论文也行。很急很急,谢谢
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phq629

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-05-11 13:37:49
zhxiaofa: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-05-12 12:13:13
1.常见活性物质合成途径应该已经清楚,可根据菌种信息直接采用pcr和建库的方法开始,获得该菌株的合成基因簇,查看相关文献设计调控方法。
2.全新或新骨架化合物结构首先推测属于哪一种合成途径,然后采用兼并pcr克隆合成基因簇保守片段,测序后可以通过步移克隆也可以构建文库克隆到想要的基因簇;或者采用转座子插入失活获得相关基因;也可以高通量测序后生物信息学分析得到合成基因簇
3.关于调控需要具体问题具体分析了
7楼2012-05-10 21:17:42
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-08 13:42:31
一般研究的是次级代谢产物的生物合成.这些基因在微生物中一般成簇排列。运用基因组扫描手段获取基因组序列,结合次级代谢产物的结构特征,寻找特定基因,根据成簇排列特点,运用生物信息学,分析预测基因簇中各基因功能.既包含结构基因和调控基因..
2楼2012-05-08 01:15:40
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mlanqiang

木虫之王 (文学泰斗)

蓝博士

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一般使用基因组扫描手段获取基因组序列。
蓝精灵
3楼2012-05-08 06:08:03
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zhaognk

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助,欢迎交流 2012-05-08 13:43:01
zhxiaofa: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-05-12 12:12:59
我的前老板经常说的一句话
如果不知道该怎么做 那就做筛选
两种筛选方法
建基因组随机突变文库 可以用Tn5等转座子插入 看那个突变体不能产你要的代谢产物了 那它的插入位点肯定是和代谢物合成相关的
或者建质粒文库 把你的微生物基因组随机打碎 连接到质粒载体上去 转入一个不能产这种代谢物的菌株中 看那个克隆可以获得生产这种代谢物的能力 那转入的片段肯定是和代谢物合成相关的
4楼2012-05-08 08:14:38
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