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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » PBS脚本如何编译？
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c03185

新虫 (小有名气)

[求助] PBS脚本如何编译？

本人新手。
不知道提交VASP任务的PBS脚本该如何编写阿？
在集群上是用mpif90编译的vasp.
直接运行vasp可以计算，用mpirun也可以并行计算，但是不知道怎么用qsub提交任务？
请高手指导。谢谢！！！！！！！！！！！！
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1楼2012-04-21 05:29:48
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zzy870720z: 金币+3, 谢谢指教 2012-04-21 09:02:19
c03185: 金币+18, ★★★很有帮助 2012-04-21 17:59:52
## Specify the job name
##PBS -S /bin/sh
#PBS -N vasp
##PBS -q zhou2

## Join the standard error and the standard output into 1 file output
#PBS -j oe
##PBS -m be
#PBS -V

## Set number of nodes and number of processor per node
#PBS -l nodes=1:ppn=12
cd $PBS_O_WORKDIR
mpirun -np 12 vasp

rm -rf $PBS_JOBID-$PBS_JOBCOOKIE.hosts

把以上内容放入一个文件（name）中，需要提交任务的时候把这个文件拷贝到你的文件夹下，然后 qsub name，就可以了。把zhou，换成你的名字
赞一下 回复此楼
嘟啦啦嘟啦啦嘟
3楼2012-04-21 08:42:25
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查看全部 6 个回答

chenweiguang

金虫 (小有名气)
★
zzy870720z: 金币+1, 谢谢指教 2012-04-21 09:02:26
这个应该去问你们的服务器管理员啊。
赞一下 回复此楼
2楼2012-04-21 06:16:09
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xiaoyukaka

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-04-21 11:53:43
在大型计算机上运行脚本，管理员应该会统一编写啊，尤其是路径设置不要弄错了哦~
qsub 脚本名：提交任务
qstat ：查看运行状况
qdel 作业号：删除任务~
希望对你有帮助
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4楼2012-04-21 10:31:13
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c03185

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-04-21 08:42:25:
## Specify the job name
##PBS -S /bin/sh
#PBS -N vasp
##PBS -q zhou2

## Join the standard error and the standard output into 1 file output
#PBS -j oe
##PBS -m be
#PBS -V

## Set number o ...

请问zhou换成我的哪个名字？
赞一下 回复此楼
5楼2012-04-21 16:25:56
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