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c03185

新虫 (小有名气)

[求助] PBS脚本如何编译?

本人新手。
不知道提交VASP任务的PBS脚本该如何编写阿?
在集群上是用mpif90编译的vasp.
直接运行vasp可以计算,用mpirun也可以并行计算,但是不知道怎么用qsub提交任务?
请高手指导。谢谢!!!!!!!!!!!!
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chenweiguang

金虫 (小有名气)


zzy870720z: 金币+1, 谢谢指教 2012-04-21 09:02:26
这个应该去问你们的服务器管理员啊。
2楼2012-04-21 06:16:09
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zzy870720z: 金币+3, 谢谢指教 2012-04-21 09:02:19
c03185: 金币+18, ★★★很有帮助 2012-04-21 17:59:52
## Specify the job name
##PBS -S /bin/sh
#PBS -N vasp
##PBS -q zhou2

## Join the standard error and the standard output into 1 file output
#PBS -j oe
##PBS -m be
#PBS -V

## Set number of nodes and number of processor per node
#PBS -l nodes=1:ppn=12
cd $PBS_O_WORKDIR
mpirun -np 12 vasp

rm -rf $PBS_JOBID-$PBS_JOBCOOKIE.hosts

把以上内容放入一个文件(name)中,需要提交任务的时候把这个文件拷贝到你的文件夹下,然后 qsub name,就可以了。把zhou,换成你的名字
嘟啦啦嘟啦啦嘟
3楼2012-04-21 08:42:25
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xiaoyukaka

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+2, 谢谢指教 2012-04-21 11:53:43
在大型计算机上运行脚本,管理员应该会统一编写啊,尤其是路径设置不要弄错了哦~
qsub 脚本名:提交任务
qstat :查看运行状况
qdel 作业号:删除任务~
希望对你有帮助
4楼2012-04-21 10:31:13
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c03185

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 贺仪 at 2012-04-21 08:42:25:
## Specify the job name
##PBS -S /bin/sh
#PBS -N vasp
##PBS -q zhou2

## Join the standard error and the standard output into 1 file output
#PBS -j oe
##PBS -m be
#PBS -V

## Set number o ...

请问zhou换成我的哪个名字?
5楼2012-04-21 16:25:56
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贺仪

铁杆木虫 (著名写手)


liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-04-21 18:36:49
引用回帖:
5楼: Originally posted by c03185 at 2012-04-21 16:25:56:
请问zhou换成我的哪个名字?

随便什么名字,这个是你提交任务后显示的任务名称
嘟啦啦嘟啦啦嘟
6楼2012-04-21 16:45:39
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