| 查看: 2297 | 回复: 5 | |||
c03185新虫 (小有名气)
|
[求助]
PBS脚本如何编译？
|
|
本人新手。 不知道提交VASP任务的PBS脚本该如何编写阿？ 在集群上是用mpif90编译的vasp. 直接运行vasp可以计算，用mpirun也可以并行计算，但是不知道怎么用qsub提交任务？ 请高手指导。谢谢！！！！！！！！！！！！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Photochemistry |
» 猜你喜欢
申请环境，微生物方向博士
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有4人回复
-
延安大学回应“副教授留绝笔信”：确已离世，正核实举报内容
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- PBS脚本的编写问题
已经有15人回复
- 一个PBS脚本同时运行多个任务
已经有6人回复
- 关于linux下的任务管理软件比如PBS
已经有10人回复
- 如何让pbs脚本提交时，跳过一些节点！
已经有5人回复
- 集群和进程的问题
已经有3人回复
- 如何写提交任务的脚本
已经有7人回复
- Linux下MS5.5安装成功，但只能在管理节点运行，无法在计算节点并行运行
已经有5人回复
- linux下如何设置脚本文件让matlab自动运行程序？
已经有4人回复
- pwscf并行计算时总是隔一段时间重新开始
已经有5人回复
- 采用PBS脚本第一次提交任务，算了1步就被杀死，有错误提示但不知道原因？
已经有19人回复
- VASP并行计算时，提示“超过CPU时限”而退出计算。请问如何解决？
已经有11人回复
- 怎么样禁止绕开队列提交任务？
已经有21人回复
- PBS脚本提交后Error
已经有11人回复
- 如何在计算机群上安装G09
已经有9人回复
- 如何编写PBS作业的脚本？
已经有14人回复
- vasp编译通过，前台算ok，去qsub到后台，找不到libmkl_lapack.so
已经有19人回复
- 【求助】vasp作业提交脚本
已经有5人回复
- 【转帖】PBS安装
已经有11人回复
chenweiguang
金虫 (小有名气)
- 应助: 11 (小学生)
- 金币: 576.2
- 红花: 4
- 帖子: 281
- 在线: 153.6小时
- 虫号: 441663
- 注册: 2007-10-27
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2012-04-21 06:16:09
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zzy870720z: 金币+3, 谢谢指教 2012-04-21 09:02:19
c03185: 金币+18, ★★★很有帮助 2012-04-21 17:59:52
感谢参与，应助指数 +1
zzy870720z: 金币+3, 谢谢指教 2012-04-21 09:02:19
c03185: 金币+18, ★★★很有帮助 2012-04-21 17:59:52
|
## Specify the job name ##PBS -S /bin/sh #PBS -N vasp ##PBS -q zhou2 ## Join the standard error and the standard output into 1 file output #PBS -j oe ##PBS -m be #PBS -V ## Set number of nodes and number of processor per node #PBS -l nodes=1:ppn=12 cd $PBS_O_WORKDIR mpirun -np 12 vasp rm -rf $PBS_JOBID-$PBS_JOBCOOKIE.hosts 把以上内容放入一个文件（name）中，需要提交任务的时候把这个文件拷贝到你的文件夹下，然后 qsub name，就可以了。把zhou，换成你的名字 |
3楼2012-04-21 08:42:25
xiaoyukaka
木虫 (正式写手)
- 应助: 28 (小学生)
- 金币: 4213.1
- 散金: 1151
- 红花: 6
- 帖子: 310
- 在线: 236.4小时
- 虫号: 1401576
- 注册: 2011-09-14
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
4楼2012-04-21 10:31:13
c03185
新虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 155.4
- 散金: 10
- 帖子: 220
- 在线: 77.9小时
- 虫号: 1321498
- 注册: 2011-06-12
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
5楼2012-04-21 16:25:56
6楼2012-04-21 16:45:39
