应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助】vasp作业提交脚本
61/1返回列表
查看: 3308  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

dingfengbo

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】vasp作业提交脚本 已有4人参与

vasp中作业提交的脚本程序.pbs文件如下：
JOBINFOR=$PBS_JOBID
MASTERNODE=`hostname`
SCRATCHDIR=$PBS_JOBID
NCPU=`wc -l < $PBS_NODEFILE`

SERVER=$PBS_O_HOST
WORKDIR=$PBS_O_WORKDIR
MKDIR=/bin/mkdir
RSH=/usr/bin/rsh
CP=/bin/cp
cat $PBS_NODEFILE > $WORKDIR/mpihosts
#LAUNCH="/opt/pgi/7.11/linux86-64/7.1/mpi/openmpi/bin/mpirun --hostfile  $WORKDIR/mpihosts -np $NCPU"
LAUNCH="mpirun --hostfile  $WORKDIR/mpihosts -np $NCPU"
PROGRAMEXEC="./run"
#PROGRAMEXEC="/opt/vasp/vasp_pgi"
中红色显示的命令是什么意思？是用什么语言来编写的呢？希望会的能帮忙指点一下！谢谢

[ Last edited by dingfengbo on 2010-10-3 at 19:05 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

first principle

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-10-03 19:04:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

calos818

木虫 (著名写手)

新人菜鸟
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
帮顶，想学学
回复此楼
2楼2010-10-03 21:10:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zxzj05(金币+1):奖励一下 2010-10-05 17:04:52
这就是专门的PBS脚本，其实仔细看看就明白了。
LAUNCH就是PROGRAMEXE启动的方式，mpirun调用hostfile和申请$NCPU个CPU，而run是真正启动的程序。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-10-03 22:02:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dingfengbo

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by bingmou at 2010-10-03 22:02:32:
这就是专门的PBS脚本，其实仔细看看就明白了。
LAUNCH就是PROGRAMEXE启动的方式，mpirun调用hostfile和申请$NCPU个CPU，而run是真正启动的程序。

谢谢
另外还想请教一下PBS脚本编写用的是哪一种计算机语言？我们的是并行计算，我的帐号和其他的帐号能共用一个作业提交脚本吗？如果不能应该改什么地方呢？刚学对很多地方都不懂！烦请指教！谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2010-10-05 11:14:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bingmou

金虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
cenwanglai(金币+1):谢谢回复！ 2010-10-07 11:24:12
PBS是一个作业提交软件，脚本的作用就是告诉这个软件如何对提交的人物分配CPU和权限。
所有人用一个脚本也是可以的
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-10-05 20:08:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

锐利的碎片

木虫 (正式写手)

star watcher
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
bingmou(金币+1):感谢指出！ 2010-10-06 09:59:01
PBS只影响计算资源分配，就是以脚本开头用#PBS开头的几个参数，其余的就是普通的shell脚本了。
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-10-05 21:14:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dingfengbo 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 材料方向考博，求推荐 +3 言语aaa 2026-04-05 4/200 2026-04-08 22:22 by nxgogo
[考研] 298求调剂 +6 钉叮咚冬瓜 2026-04-07 8/400 2026-04-08 10:51 by 中飞院空管学院�
[考研] 调剂 +3 电气300求调剂不 2026-04-08 6/300 2026-04-08 09:39 by 电气300求调剂不
[考研] 388求调剂 +6 四川王涛 2026-04-07 8/400 2026-04-08 00:17 by JourneyLucky
[考研] 305求调剂 +4 77Qi 2026-04-06 4/200 2026-04-07 20:06 by shanqishi
[考研] 277求调剂 数一104分 +9 瓶子PZ 2026-04-05 14/700 2026-04-07 17:52 by 蓝云思雨
[考研] 338求调剂 +4 我想上岸ii 2026-04-05 4/200 2026-04-06 21:04 by 木子君1218
[考研] 287求调剂 +3 通信学硕081000 2026-04-03 4/200 2026-04-06 21:03 by going home
[考研] 生物学求调剂 一志愿沪9，326分 +6 刘墨墨 2026-04-06 6/300 2026-04-06 19:36 by lijunpoly
[考研] 一志愿211，化学学硕，310分，本科重点双非，求调剂 +13 努力奋斗112 2026-04-04 13/650 2026-04-06 07:13 by jj987
[考研] 313求调剂 +5 海日海日 2026-04-04 5/250 2026-04-05 15:52 by jndximd
[考研] 353求调剂 +10 MayUxw1 2026-04-03 10/500 2026-04-05 09:23 by 无际的草原
[考研] 材料与化工306分找调剂 +23 沧海轻舟e 2026-04-02 27/1350 2026-04-04 21:52 by laoshidan
[考研] 341求调剂 +3 洛多罗 2026-04-02 4/200 2026-04-04 21:36 by 智能智慧
[考研] 301求调剂 +18 骆驼男人 2026-04-02 18/900 2026-04-04 20:33 by 蓝云思雨
[考研] 一志愿沪9，求生物学调剂，326分 +6 刘墨墨 2026-04-04 6/300 2026-04-04 19:44 by 唐沐儿
[考研] 309求调剂 +6 刘刘刘1231 2026-04-02 7/350 2026-04-04 13:41 by liucky
[考研] 材料295 +13 小英11 2026-04-03 14/700 2026-04-04 09:02 by 来看流星雨10
[考研] 335求调剂 +7 沈清璃 2026-04-03 7/350 2026-04-03 18:55 by lijunpoly
[考研] 293求调剂 +4 珂珂乐 2026-04-02 4/200 2026-04-02 20:10 by 6781022
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭