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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp脚本运行问题
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huangll99

木虫 (职业作家)

[求助] vasp脚本运行问题

#! /bin/bash
rm WAVECAR
for i in  3.5 3.6 3.7 3.8 3.9 4.0 4.1 4.2 4.3 ; do
cat >POSCAR < fcc:
   $i
0.5 0.5 0.0
0.0 0.5 0.5
0.5 0.0 0.5
   1
cartesian
0 0 0
!
echo "a= $i"
mpirun -np 8 /usr/local/vasp.4.6/vasp > out&
E=`tail -1 OSZICAR` ; echo $i $E  >>SUMMARY.fcc
done
cat SUMMARY.fcc

运行时出现下列问题，请各位大侠指教

rm: cannot remove `WAVECAR': No such file or directory
a= 3.5
tail: cannot open `OSZICAR' for reading: No such file or directory
a= 3.6
tail: cannot open `OSZICAR' for reading: No such file or directory
a= 3.7
tail: cannot open `OSZICAR' for reading: No such file or directory
a= 3.8
tail: cannot open `OSZICAR' for reading: No such file or directory
a= 3.9
tail: cannot open `OSZICAR' for reading: No such file or directory
a= 4.0
tail: cannot open `OSZICAR' for reading: No such file or directory
a= 4.1
tail: cannot open `OSZICAR' for reading: No such file or directory
a= 4.2
tail: cannot open `OSZICAR' for reading: No such file or directory
a= 4.3
tail: cannot open `OSZICAR' for reading: No such file or directory
3.5
3.6
3.7
3.8
3.9
4.0
4.1
4.2
4.3
[renjie@power5506 2_1_fccSi]$ poll: protocol failure in circuit setup
poll: protocol failure in circuit setup
poll: protocol failure in circuit setup
poll: protocol failure in circuit setup
poll: protocol failure in circuit setup
poll: protocol failure in circuit setup
poll: protocol failure in circuit setup
poll: protocol failure in circuit setup
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1楼 2012-02-26 21:37:10
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liliangfang

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
WDD880227(金币+1): 感谢交流提示 2012-02-26 22:10:57
huangll99(金币+10): ★★★★★最佳答案 谢谢 2012-02-27 09:50:10
这个可能你脚本里面的有错误的字符导致的，检查一下里面的字符，`这个最会出错，脚本要自己写，复制会出问题
赞一下 回复此楼
2楼2012-02-26 22:06:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangll99

木虫 (职业作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liliangfang at 2012-02-26 22:06:15:
这个可能你脚本里面的有错误的字符导致的，检查一下里面的字符，`这个最会出错，脚本要自己写，复制会出问题

斑竹，再问你一个问题，如果我想让这个脚本后台运行，不在屏幕上显示东西，nohup这个命令该怎么用，帮帮忙，多谢啦
赞一下 回复此楼
3楼2012-02-27 09:52:54
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enola

捐助贵宾 (正式写手)
franch(金币+2): 谢谢回帖交流。。。。 2012-02-27 13:40:16
引用回帖:
3楼: Originally posted by huangll99 at 2012-02-27 09:52:54:
斑竹，再问你一个问题，如果我想让这个脚本后台运行，不在屏幕上显示东西，nohup这个命令该怎么用，帮帮忙，多谢啦

nohup ./XX.bash &
这样提交任务后，就会在后台运行，终端可以关掉。
赞一下(2人) 回复此楼
timeflies..
4楼2012-02-27 12:11:01
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liliangfang

荣誉版主 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by enola at 2012-02-27 12:11:01:
nohup ./XX.bash &
这样提交任务后，就会在后台运行，终端可以关掉。

谢谢回复，楼主试试吧
赞一下 回复此楼
5楼2012-02-27 14:46:52
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豆豆王王

铜虫 (小有名气)
请问楼主的问题是怎么解决的
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6楼2012-10-25 15:55:24
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hythen

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 豆豆王王 at 2012-10-25 15:55:24
请问楼主的问题是怎么解决的

这个提示其实不成问题，你就是看看文件后面的修改时间，如果不再运行，就检查一下测试文件，大小写啊标点啊什么的再试试~
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7楼2012-12-30 21:36:37
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豆豆王王

铜虫 (小有名气)
  谢谢楼主，不过问题早就解决啦
赞一下 回复此楼
8楼2012-12-31 09:02:53
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