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可帅儿

银虫 (正式写手)


[交流] 扩增曲线不平滑是怎么回事?

我又来了。。。
今天又做了一批荧光PCR,最后的结果是大致的曲线走向都对的,就是有个问题曲线不够平滑。图在下面。以前做了几次也有这个问题呢~请问这会是什么原因?
P.S.我用的是ABI7500做的,想同时做出扩增曲线和溶解曲线,请问有木有熟悉仪器的大虾,应该怎么setup才行呢?貌似实验type只能是一种。。。
配工作液还不太熟练,我怕配错;于是想一管一管加,这样至少不会有差错。










这是4个重复的反应,用的是50ul体系












这也是4个重复的,但是100ul体系,貌似效果比50 的好



[ Last edited by 可帅儿 on 2012-4-19 at 13:42 ]
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atlanticwi

金虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西瓜: 金币+3, Good!加不加差别确实不大,不过加了的话重复性好很多,个人经验~ 2012-05-07 17:56:43
引用回帖:
33楼: Originally posted by 可帅儿 at 2012-05-04 11:18:10:
谢谢专家指教!
我应该是没加,我用的是mix试剂,这个是要额外加吗?

大姐啊
幸亏回来看到这帮人在这说了
你应该看看试剂说明书的 ROX染料一般都是直接加入的
我用的TOYOBO Mix就是这样的
你可以看看试剂盒里哪里有什么额外的ROX让你加的啦...........
如果你的Mix是呈现微微一点红色的话 本身就说明有ROX染料的啦..................................
如果有问题 只能是你没有设定去读ROX 而不是没加ROX
再者有没有读ROX的影响我试过 比较微小(也不排除实验条件未优化造成的大差异) 本来ROX是用来矫正孔间差异的,若是有ROX和没有ROX下区别那么大 这个做机器的公司就可以去死了.......................
个人看法 若有说错请高手指点

[ Last edited by atlanticwi on 2012-5-6 at 21:22 ]
38楼2012-05-06 21:14:41
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查看全部 56 个回答

可帅儿

银虫 (正式写手)


哎~~自己来顶顶!求大神指点(⊙o⊙)哦
2楼2012-04-19 13:44:05
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chlorella409

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★
可帅儿(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+4, Good! 2012-04-19 17:27:17
首先我认为扩增曲线不光滑可能时因为还在基线期,其次,你要加溶解曲线的话可以在experiment menu的experiment properties里面选择检测试剂SYBRgreen下面就可以看到include melt curve在前面小框里打钩,第三,工作液可以先mix再分到每个孔里,cDNA最后加

[ Last edited by chlorella409 on 2012-4-19 at 15:55 ]
3楼2012-04-19 15:53:18
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atlanticwi

金虫 (正式写手)


★ ★ ★
可帅儿(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+2, Good! 2012-04-19 17:26:48
嗯...........
感觉体系过大了哦,100uL体系完全没有必要的,同时你用的什么MasterMix呢,还有感觉前面几个图不是不平滑,而是没有起峰呢

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4楼2012-04-19 16:19:06
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