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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 扩增曲线不平滑是怎么回事？
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可帅儿

银虫 (正式写手)

[交流] 扩增曲线不平滑是怎么回事？

我又来了。。。
今天又做了一批荧光PCR，最后的结果是大致的曲线走向都对的，就是有个问题曲线不够平滑。图在下面。以前做了几次也有这个问题呢~请问这会是什么原因？
P.S.我用的是ABI7500做的，想同时做出扩增曲线和溶解曲线，请问有木有熟悉仪器的大虾，应该怎么setup才行呢？貌似实验type只能是一种。。。
配工作液还不太熟练，我怕配错；于是想一管一管加，这样至少不会有差错。










这是4个重复的反应，用的是50ul体系












这也是4个重复的，但是100ul体系，貌似效果比50 的好



[ Last edited by 可帅儿 on 2012-4-19 at 13:42 ]
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1楼 2012-04-17 15:30:17
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txw87

木虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-04 13:51:35
引用回帖:
31楼: Originally posted by 可帅儿 at 2012-05-04 11:02:49:
请问ROX是什么?我不太明白，请指教

ROX是一种参比染料，ABI的仪器在读取荧光信号值时同时也会读取ROX的值，因为ROX的荧光值是恒定的，所以通过这个可以校正孔间差异和每个循环读取信号的不稳定。
仪器配套软件在绘图时是考虑ROX值的，如果你没加的话，曲线就很难看，估计你应该是没加。
这个是可以在设置里修改的，但看你貌似对仪器不熟，所以可能是没把这个选项去掉。
一般的实时反应Mix里都会送两种参比染料，ROX和ROX II，ABI 7500应该加ROX II，其他机型要看试剂说明书。
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可帅儿
32楼2012-05-04 11:09:27
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可帅儿

银虫 (正式写手)
哎~~自己来顶顶！求大神指点(⊙o⊙)哦
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2楼2012-04-19 13:44:05
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chlorella409

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★
可帅儿(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+4, Good！ 2012-04-19 17:27:17
首先我认为扩增曲线不光滑可能时因为还在基线期，其次，你要加溶解曲线的话可以在experiment menu的experiment properties里面选择检测试剂SYBRgreen下面就可以看到include melt curve在前面小框里打钩，第三，工作液可以先mix再分到每个孔里，cDNA最后加

[ Last edited by chlorella409 on 2012-4-19 at 15:55 ]
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3楼2012-04-19 15:53:18
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atlanticwi

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
可帅儿(金币+1): 谢谢参与
西瓜: 金币+2, Good！ 2012-04-19 17:26:48
嗯...........
感觉体系过大了哦，100uL体系完全没有必要的，同时你用的什么MasterMix呢，还有感觉前面几个图不是不平滑，而是没有起峰呢
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可帅儿
4楼2012-04-19 16:19:06
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