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liulinlinyan铜虫 (正式写手)
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[交流]
gromacs 蛋白质自组装 已有1人参与
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请教各位高手，gromacs中是否可以实现蛋白质的静电自组装，能否推荐一下相关的教程或者参考之类的；还有就是MARTINI力场能否实现对于蛋白质自组装的模拟研究，我看官网上说起不能进行蛋白质折叠的研究，那么蛋白质的折叠与蛋白质的自组装之间具有怎样的差别呢，另外对于NAMD和gromacs，哪一个对于模拟较好呢？首先先感谢各位的积极参与讨论以及指点！ [ Last edited by liulinlinyan on 2012-4-15 at 19:14 ] |
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liulinlinyan
铜虫 (正式写手)
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3楼2012-04-20 16:38:59
jawang
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-04-18 19:38:52
| MARTINI力场由于在力场参数中需要确定蛋白的二级结构，所以不能用来研究蛋白质折叠的研究。对于软件NAMD和gromacs应该都差不多，不过上手本人觉得gromacs很快。 |
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2楼2012-04-18 19:03:25