| 查看: 836 | 回复: 2 | |||
liulinlinyan铜虫 (正式写手)
|
[交流]
gromacs 蛋白质自组装 已有1人参与
|
|
请教各位高手，gromacs中是否可以实现蛋白质的静电自组装，能否推荐一下相关的教程或者参考之类的；还有就是MARTINI力场能否实现对于蛋白质自组装的模拟研究，我看官网上说起不能进行蛋白质折叠的研究，那么蛋白质的折叠与蛋白质的自组装之间具有怎样的差别呢，另外对于NAMD和gromacs，哪一个对于模拟较好呢？首先先感谢各位的积极参与讨论以及指点！ [ Last edited by liulinlinyan on 2012-4-15 at 19:14 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
333求调剂
已经有9人回复
-
070300化学学硕311分求调剂
已经有3人回复
-
321求调剂
已经有13人回复
-
348求调剂
已经有4人回复
-
0703化学
已经有8人回复
-
材料调剂
已经有11人回复
-
081700学硕，323分，一志愿中国海洋大学求调剂学校
已经有10人回复
-
0703求调剂383分
已经有7人回复
-
0703化学调剂325分
已经有4人回复
-
329求调剂
已经有15人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教GROMACS安装
已经有8人回复
- 求Gromacs中Glycam力场数据包。。非常感谢
已经有5人回复
- Gromacs进行带电体系的模拟
已经有3人回复
- 【求助】如何使用gromacs中的constraint
已经有8人回复
- 【求助】怎样才能使整个盒子充满水,用gromacs
已经有6人回复
- 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢
已经有11人回复
- 【原创】在gromacs的gro中插入小分子
已经有12人回复
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多吗？如何选择？
已经有7人回复
- 【求助】NAMD和Gromacs哪个简单？
已经有5人回复
- 【讨论】介观模拟
已经有7人回复
- 【求助】求GROMACS模拟表面活性剂在油水表面的行为的例子
已经有7人回复
jawang
木虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3533.7
- 散金: 43
- 红花: 1
- 帖子: 376
- 在线: 214.7小时
- 虫号: 838608
- 注册: 2009-09-02
- 性别: GG
- 专业: 药物设计与药物信息
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-04-18 19:38:52
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-04-18 19:38:52
| MARTINI力场由于在力场参数中需要确定蛋白的二级结构，所以不能用来研究蛋白质折叠的研究。对于软件NAMD和gromacs应该都差不多，不过上手本人觉得gromacs很快。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
liulinlinyan2楼2012-04-18 19:03:25
liulinlinyan
铜虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 40
- 散金: 1
- 帖子: 347
- 在线: 13.6小时
- 虫号: 1059263
- 注册: 2010-07-17
- 专业: 理论和计算化学
3楼2012-04-20 16:38:59
5