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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 如何查找一个基因的转录起始位点
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xiaoyugutou

捐助贵宾 (小有名气)

[求助] 如何查找一个基因的转录起始位点

找到一个基因后，怎样看哪里是它的转录起始位点？
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1楼 2012-04-09 11:38:51
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bbwalkman

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+5, 专家考核, 鼓励应助，挺详细的 2012-04-10 09:19:59
转录起始位点是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基，通常为一个嘌呤（A或G）。一般转录起始位点的上游都有雨RNA聚合酶结合的启动子区域，是不是可以根据这个来大致确定一下你的转录起始位点。
1.原核生物中，绝大部分启动子都存在-10bp处的TATA区和-35bp处的TTGACA区，它们是RNA聚合酶和启动子的结合位点，然后看看它大致能不能粗略确定转录起始位点
2.真核生物钟，主要的结合位点是转录起始位点上游-25~-30bp的TATAAA区和-70~-78bp的CCAAT区
3.上NCBI上看看通过基因序列，能不能确定你的转录起始位点。
祝好运
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3楼2012-04-09 20:17:29
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xiaoyugutou

捐助贵宾 (小有名气)
可是ATG是翻译起始位点啊，ATG上游应该还有5UTR啊
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2楼2012-04-09 17:05:04
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xiaoyugutou

捐助贵宾 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by bbwalkman at 2012-04-09 20:17:29:
转录起始位点是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基，通常为一个嘌呤（A或G）。一般转录起始位点的上游都有雨RNA聚合酶结合的启动子区域，是不是可以根据这个来大致确定一下你的转录起始位点。
1.原核 ...

我知道有的基因已经已知转录起始位点了，有些还未知，就是不知道怎么知道我找的那些是已知的还是未知的，序列里面也没有特殊标明
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4楼2012-04-10 19:49:28
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farmer@

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
xiaoyugutou: 金币+1, ★有帮助 2012-10-25 09:35:17
用5' RACE吧，可以扩增到全长mRNA的5'端序列，转录起始点自然就知道了。
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5楼2012-10-21 20:28:11
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