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dfm1987

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
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在线: 7.1小时
虫号: 1736915
注册: 2012-04-05
专业: 色谱分析

[求助] PBI121载体转化拟南芥，Tail-PCR扩增整合位点侧翼序列，为何只扩增得到载体部分序列？已有1人参与

我用热不对称方法扩增PBI121载体转化拟南芥得到的转化子的T-DNA整合位点侧翼序列；上游简并引物和下游特异性序列（RB区域）都是别人文献当中用过的，但是第三轮引物扩增的结果1000bp左右，经测序结果验证依然是PBI121的序列（RB区域上游）。我一直以为PBI121的整合特点是从RB和LB区域断开，整合到植物基因组中，但是我扩增出的结果又好像不是。求解，请各位大侠帮帮忙！还有一般大家是用哪种方法扩增T-DNA整合位点侧翼序列的？

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1楼2012-04-05 16:35:06

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lzh860801

金虫 (正式写手)

应助: 3 (幼儿园)
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性别: GG
专业: 植物遗传学

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-10 18:36:29

lz你的情况和我很相似啊
我是设计的LB的引物然后调到了载体内部去了
序列比对的时候发现NCBI上面PBI121这个载体有几个修改过的它们的LB RB是反的所以我目前把引物反过来设计准备重新调了

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

8楼2012-04-10 17:10:04

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

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