应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助： 已知引物的碱基序列，如何计算引物的长度？
51/1返回列表
查看: 7304  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

li123cl

木虫 (正式写手)

[求助] 求助： 已知引物的碱基序列，如何计算引物的长度？

各位大虾，本人由于初次尝试PCR实验，遇到了一点问题，不是很了解，恳求各位大侠不吝赐教。
已知引物的序列如下，如何计算它们的长度（bp表示）？
Gene        Primer (5’-3’)                                         Length (bp)
β-Actin        Forward: GAAGATCCTGACCGAGCGT            ？
                 Reverse: CCACAGGATTCCATACCCAA       
NR1        Forward: CGGAGTTTCTCTGCTCGTA
                 Reverse: TCATGGGACTTGAGTATGGA       
NR2A        Forward: GCTACGGGCAGACAGAGAAG
                Reverse: GTGGTTGTCATCTGGCTCAC       
NR2B        Forward: GCTACAACACCCACGAGAAGAG
                 Reverse: GAGAGGGTCCACGCTTTCC       
引物合成公司提供的信息上只有碱基数，退火温度，n mols等。没有bp表示的长度。还是用那些Primer5.0和oligo.60软件进行计算？
谢谢。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-04-04 17:47:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

XOooZzz

银虫 (小有名气)
什么长度？引物的长度还是扩增产物的长度？引物长度就是碱基数啊亲
赞一下 回复此楼
4楼2012-04-04 21:34:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

zhaohq1209

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
length简单得很啊，数一下有多少个碱基不就行了么
赞一下 回复此楼
我有一个梦想，我梦想有一天，我们的人民可以根据自己的意愿与消费能力，居住在自己愿意居住的地方。
2楼2012-04-04 18:00:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

孙启亮

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜: 金币+1, Good! 2012-04-04 22:17:03
li123cl: 金币+5 2012-04-04 22:27:53
将引物序列提交到NCBI进行primer blast，这样不仅能获得你的扩增产物长度，而且能够检测你的引物特异性。网址为http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tool ... ?LINK_LOC=BlastHome
赞一下 回复此楼
3楼2012-04-04 19:09:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjb3344

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
确定上下游引物的位置
比如上游起始位置 10位
下游为500
则扩增产物的长度为 下游-上游+下游碱基数
赞一下 回复此楼
不论在世界的任何角落·都要感到幸福
5楼2012-04-04 21:47:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 271求调剂 +12 生如夏花… 2026-03-11 14/700 2026-03-17 10:56 by lovewei0727
[考研] 11408 一志愿西电，277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 药学383 求调剂 +3 药学chy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 20:51 by 元子^0^
[考研] 290求调剂 +5 孔志浩 2026-03-12 10/500 2026-03-16 09:01 by 余晖&
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +6 zlingli 2026-03-13 6/300 2026-03-15 20:00 by ryzcf
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[考研] 复试调剂 +9 Copy267 2026-03-10 9/450 2026-03-13 23:45 by userper
[考研] 0805，333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +3 zjy101327 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:48 by JourneyLucky
[考研] 求调剂（材料与化工327） +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 296求调剂 +3 大口吃饭 身体健 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:31 by 学员8dgXkO
[考研] 化工学硕306求调剂 +9 42838695 2026-03-12 9/450 2026-03-13 10:16 by houyaoxu
[考研] 大连大学化学专业研究生调剂 +3 琪久. 2026-03-10 8/400 2026-03-11 10:02 by 琪久.
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭