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涌动的泉

铜虫 (知名作家)

[求助] 求高手指点:对于保守性较低的基因可以用简并引物来扩吗?

以前没做过基因克隆,对这方面很陌生,所以寻求大家的帮助
我现在要做的基因比较小500-700bp,找了亲缘关系较近的物种的基因序列通过DNAMAN比对发现同源性只有44%左右。高手们看看这种情况能通过设计简并引物扩出目的片段么?
还有没有其他好办法吗?
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我们的过去,成就了如今的我们,无需悔恨
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涌动的泉

铜虫 (知名作家)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 石紫儿 at 2012-04-01 10:39:52:
楼主你好,不知道你现在做的怎么样了,设计的简并引物做的吗?


我也是这样的情况,同源性很低还不到40%,设计的简并引物但是不出结果,是杂带在100bp附近,像是引物交联又不是,因为目标条带150bp,有没有高 ...

我现在还在尝试阶段,结果也不好,坐等高手出现呢
我们的过去,成就了如今的我们,无需悔恨
7楼2012-04-01 11:33:22
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涌动的泉

铜虫 (知名作家)

营造好气氛,等待高手进来
我们的过去,成就了如今的我们,无需悔恨
3楼2012-03-24 08:20:57
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涌动的泉

铜虫 (知名作家)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 苏拉的世界 at 2012-03-24 11:37:38:
试试吧

我看了有的人说简并引物的设计,最好是3-5个序列比对后在同源性较高的区域里设,可是这个基因保守性不强,我已经减到两条基因了,但是同源性照样很低~~
怎么办呀?求指点
我们的过去,成就了如今的我们,无需悔恨
5楼2012-03-24 19:48:42
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石紫儿

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 涌动的泉 at 2012-03-24 19:48:42:
我看了有的人说简并引物的设计,最好是3-5个序列比对后在同源性较高的区域里设,可是这个基因保守性不强,我已经减到两条基因了,但是同源性照样很低~~
怎么办呀?求指点

楼主你好,不知道你现在做的怎么样了,设计的简并引物做的吗?


我也是这样的情况,同源性很低还不到40%,设计的简并引物但是不出结果,是杂带在100bp附近,像是引物交联又不是,因为目标条带150bp,有没有高手帮忙解决一下啊
6楼2012-04-01 10:39:52
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