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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求高手指点：对于保守性较低的基因可以用简并引物来扩吗？
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涌动的泉

铜虫 (知名作家)

[求助] 求高手指点：对于保守性较低的基因可以用简并引物来扩吗？

以前没做过基因克隆，对这方面很陌生，所以寻求大家的帮助
我现在要做的基因比较小500-700bp，找了亲缘关系较近的物种的基因序列通过DNAMAN比对发现同源性只有44%左右。高手们看看这种情况能通过设计简并引物扩出目的片段么？
还有没有其他好办法吗？
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我们的过去，成就了如今的我们，无需悔恨
1楼 2012-03-22 14:46:43
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涌动的泉

铜虫 (知名作家)
营造好气氛，等待高手进来
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我们的过去，成就了如今的我们，无需悔恨
3楼2012-03-24 08:20:57
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涌动的泉

铜虫 (知名作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 苏拉的世界 at 2012-03-24 11:37:38:
试试吧

我看了有的人说简并引物的设计，最好是3-5个序列比对后在同源性较高的区域里设，可是这个基因保守性不强，我已经减到两条基因了，但是同源性照样很低~~
怎么办呀？求指点
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我们的过去，成就了如今的我们，无需悔恨
5楼2012-03-24 19:48:42
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石紫儿

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 涌动的泉 at 2012-03-24 19:48:42:
我看了有的人说简并引物的设计，最好是3-5个序列比对后在同源性较高的区域里设，可是这个基因保守性不强，我已经减到两条基因了，但是同源性照样很低~~
怎么办呀？求指点

楼主你好，不知道你现在做的怎么样了，设计的简并引物做的吗？


我也是这样的情况，同源性很低还不到40%，设计的简并引物但是不出结果，是杂带在100bp附近，像是引物交联又不是，因为目标条带150bp，有没有高手帮忙解决一下啊
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6楼2012-04-01 10:39:52
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涌动的泉

铜虫 (知名作家)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 石紫儿 at 2012-04-01 10:39:52:
楼主你好，不知道你现在做的怎么样了，设计的简并引物做的吗？


我也是这样的情况，同源性很低还不到40%，设计的简并引物但是不出结果，是杂带在100bp附近，像是引物交联又不是，因为目标条带150bp，有没有高 ...

我现在还在尝试阶段，结果也不好，坐等高手出现呢
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我们的过去，成就了如今的我们，无需悔恨
7楼2012-04-01 11:33:22
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