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bevan09

禁虫 (小有名气)

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zhaoghit

金虫 (正式写手)

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★ ★ ★ ★ ★
bevan09: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-03-17 19:13:57
看图片也正常,你试试把梯度胶的浓度分辨率调高,40%~70%,然后跑的时候减小电压,90V这样,跑14小时左右,你再试试。你的片段太长肯定分离效果不理想的。
天道酬勤!
7楼2012-03-17 18:43:58
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whb21

木虫 (著名写手)

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你在跑DGGE前是否用样品跑过琼脂糖电泳?
2楼2012-03-16 15:04:07
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bevan09

禁虫 (小有名气)

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3楼2012-03-16 17:00:58
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zhaoghit

金虫 (正式写手)

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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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1949stone: 金币+3, 鼓励 2012-03-16 18:02:05
bevan09: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-03-16 20:52:25
首先DGGE的分辨率最好的是在250~400bp左右这样最好,你的目的片段太长势必效果很差,而且不加GC夹子,那样解链速度会很快,条带是不能很好分离出来的,不知道你用的什么引物,不行的话你可以选择小片段跑效果会好的,而且你的梯度胶分离浓度要做适当调整,效果会好些,DGGE技术基本属于过去式手段,不能过分依赖。
天道酬勤!
4楼2012-03-16 17:14:54
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bevan09

禁虫 (小有名气)

西瓜: 回帖置顶 2012-03-18 17:23:28
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5楼2012-03-16 21:01:08
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wxxmu

金虫 (小有名气)

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西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-03-18 17:23:39
看到你分离的片段是341-907,有点不明白为什么选择这么长的16S序列?800的序列是很难分离的,建议实验重新设计一下再说。
6楼2012-03-17 15:34:26
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bevan09

禁虫 (小有名气)

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8楼2012-03-17 19:22:48
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whb21

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
bevan09: 金币+2, 有帮助 2012-03-19 22:00:51
引用回帖:
2楼: Originally posted by whb21 at 2012-03-16 15:04:07:
你在跑DGGE前是否用样品跑过琼脂糖电泳?

看DGGE图片好像是有很大的拖尾降解现象,但是跑琼脂糖时却没有拖尾。。。。
建议你从降解这方面查查,看看问题在哪
9楼2012-03-19 12:07:00
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xzhiqiang

禁虫 (正式写手)

★ ★ ★
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bevan09: 金币+3, 有帮助 2012-03-19 22:00:40
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10楼2012-03-19 16:48:39
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