24小时热门版块排行榜

返回列表

happywyh

铁虫 (小有名气)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 8.2
帖子: 94
在线: 63.6小时
虫号: 1664499

[交流] 怎么判断目的基因序列中是否含有信号肽~~

从NBIC得到一段目的蛋白的编码序列（CDS），逛论坛发现有好多关于是否切除本身信号肽，利用表达载体信号肽的帖子...想请教一下怎么判断目的基因序列中是否含有信号肽以及怎么分析信号肽序列...
第一次设计引物，有很多不懂的，希望路过的大侠能帮忙解答~~谢谢~~

[ Last edited by happywyh on 2012-3-13 at 20:14 ]

回复此楼

» 猜你喜欢

金色抗生素单硫酸卡那霉素的物化性质、制备与前景已经有0人回复
解密度鲁特韦——新一代HIV整合酶抑制剂的化学、药理与产业化图景已经有0人回复
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有86人回复
左炔诺孕酮从沃氏氧化物到炔基化反应的工艺迭代与靶点解析已经有0人回复
“关闭瘙痒信号”的多肽地非法林醋酸盐全解析已经有1人回复
Tosylate-DPA-714介导¹⁸F-DPA-714 PET成像的前沿进展已经有0人回复
I-BRD9: BRD9溴结构域化学探针，BET选择性>700倍已经有0人回复
莫那利珠单抗阻断NKG2A/HLA-E抑制通路 | Biochempartner 已经有0人回复
GSPT1口服分子胶降解剂MRT-2359 | Biochempartner 已经有0人回复
碳青霉烯类抗生素为何需联用西司他丁钠？ | Biochempartner 已经有0人回复
源自蕨类植物的抗炎美白活性分子去甲氧基荚果蕨素 | Biochempartner 已经有0人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

多克隆酶切位点可以任意插入基因吗？不用考虑启动子的距离吗？已经有8人回复
如何寻找目的基因已经有6人回复
大家有没有遇到过没有信号肽有没有跨膜结构的基因？已经有7人回复
蛋白表达不出来，是什么原因造成的已经有7人回复
分析了蛋白质信号肽，但是不太会看记过，怎么看有没有信号肽？三条线分别代表什么？已经有6人回复
NCBI上酶蛋白序列含有信号肽吗（原核）已经有5人回复
如何根据CDS序列设计引物已经有3人回复
蛋白质信号肽预测的相关软件已经有8人回复
请问，两条不同来源的DNA序列，相似度达到多少时，才可以判定为同源？已经有8人回复
【资料】信号肽预测工具SignalP 3.0中文说明书【已搜索无重复】已经有273人回复
谁有可以线下使用的序列处理工具包？已经有3人回复
寻找pMD19-T全序列已经有5人回复
生信——如何利用全基因组序列找到目的基因已经有6人回复
请问下面两个序列中是否含有Kozaka序列已经有6人回复
序列相似度较低，该如何申请获得基因登陆号已经有4人回复
HMBC上季碳找不到相关信号峰已经有10人回复
如何查找基因的序列号？已经有4人回复
原核表达标签的切除，及信号肽的影响已经有5人回复
【求助/交流】基因序列的分析已经有5人回复
【求助/交流】原核表达，预测的信号肽序列是否包括已经有7人回复
【求助/交流】知道目的基因定位标记，想知道目的基因序列信息，怎么办已经有7人回复
【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构已经有12人回复
【求助/交流】Oligo dT-Adaptor Primer的基因序列已经有4人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2012-03-13 15:52:12

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

lilyjimei

新虫 (小有名气)

应助: 10 (幼儿园)
金币: 1072.8
帖子: 274
在线: 39.8小时
虫号: 1085748

★ ★ ★ ★
happywyh(金币+1): 谢谢参与
西瓜(金币+3): 热心哈 2012-03-13 23:53:41

呵呵也是问的别人滴；用在线的SignalP分析就可以了,http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-2.0/
信号肽的特征是包括一个正电荷区域、一个疏水性区域和不带电荷但具有极性的区域,信号肽切割位点的-3和-1位为小而中性氨基酸,这也是预测的依据。上面所说的SignalP可以根据信号肽序列特征，采用神经网络方法或隐马氏模型方法，对信号肽位置及切割位点进行预测。

赞一下

回复此楼

2楼2012-03-13 17:02:29

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

nanjingji

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 112.1
帖子: 6
在线: 25.8小时
虫号: 1688029

★
happywyh(金币+1): 谢谢参与

你的第一个有关信号肽的问题，我的答案同楼上，至于引物设计，我建议你使用primer primer 5 引物设计软件，这个软件很好用，而且很好学！

赞一下

回复此楼

3楼2012-03-13 17:21:14

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

happywyh

铁虫 (小有名气)

应助: 2 (幼儿园)
金币: 8.2
帖子: 94
在线: 63.6小时
虫号: 1664499

引用回帖:

楼: Originally posted by lilyjimei at 2012-03-13 17:02:29:
呵呵也是问的别人滴；用在线的SignalP分析就可以了,http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-2.0/
信号肽的特征是包括一个正电荷区域、一个疏水性区域和不带电荷但具有极性的区域,信号肽切割位点的-3和-1位为小而 ...

我按照你说的网址进行了信号肽序列的分析，得到的结果如上图所示，图像太抽象了，请问这三条线条分别代表什么意思啊

赞一下

回复此楼

4楼2012-03-13 20:57:07

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖