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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » AutoDock新手问题
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wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] AutoDock新手问题

刚刚接触AutoDock，按照教程上写的步骤进行操作，在进行Run AutoGrid的时候出现这个问题。autogrid4: ERROR:  can't find or open receptor PDBQT file "1JLV-2.pdbqt".这里面说的找不到或者不能打开PDBQT文件指的到底是什么意思？我在指定的存储目录中看到相应的PDBQT文件了，也能用文字编辑器打开。这里面说的不能打开指的是我创建的PDBQT文件不合理还是什么情况？请高手解答！谢谢！
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努力的生活着
1楼 2012-03-08 19:35:20
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longytu
chaizhm: 编辑内容 2012-04-02 18:44
1

[ Last edited by chaizhm on 2012-4-2 at 18:44 ]
4楼2012-04-02 17:25:01
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lovedi

银虫 (小有名气)
★
jiaoyixiong(金币+1): 鼓励交流 2012-03-10 09:32:47
没出现过这种问题。只在目录里不行的吧，你事先分别导入受体和配体的pdbqt文件试试，
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2楼2012-03-10 05:27:17
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lovedi

银虫 (小有名气)
★
jiaoyixiong(金币+1): 2012-03-10 09:32:55
还有就是运行autogrid得时候一定将文件路径设好，每次都要重设的
赞一下 回复此楼
3楼2012-03-10 05:29:06
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