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faile18

金虫 (小有名气)

[求助] 基因克隆PCR检测不出阳性克隆

请高手帮忙解决一下。目前正在进行载体的构建,将载体骨架进行酶切,切胶回收背景。同时克隆出目的片段,连接pGEM-T载体,转化大肠杆菌,PCR检测阳性克隆,如图1,经测序证明结果正确,选择阳性克隆进行酶切,切胶回收目的片段。背景与目的片段连接过夜,转化大肠杆菌,挑单克隆检测,此时PCR检测无法检测出阳性克隆,提取质粒后酶切检测,均为阳性,如图2,选择阳性克隆1转化农杆菌,挑取单克隆检测,此时PCR仍无法检测出阳性,但双酶切结果及单酶切比较验证均证实转化成功。利用与之前完全相同的体系对起始模板、大肠杆菌阳性克隆,以及转化的农杆菌进行PCR,体系仪器与之前完全相同,但是结果所有的PCR均无条带。酶是一个半月之前购买的,检测过没有问题,引物应该也没有问题,后来以为是dNTP的问题,试了实验室所有的dNTP,也可以扩增出来目的片段见图3,但利用相同的体系和程序又扩不出带了见图4,实在是想不出问题到底出在哪里了,急求各位帮忙啊,感激不尽。
PS:所构建的新载体与原始载体只有酶切位点之内有差异,引物经比对与所构建的载体匹配,理论上可以用PCR检测阳性克隆,但始终无法扩增出目的片段。

图4



图1



图2



图3
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fmm123

铜虫 (初入文坛)

请问楼主这个问题解决了吗?
2楼2016-01-12 15:15:56
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