| 查看: 2361 | 回复: 3 | ||
[求助]
把一个pdb的蛋白质复合物 保存成prmtop 和inpcrd 文件
|
|
复合物中小分子的名字是 19 第一步tleap 第二步 source leaprc.gaff 第三步 loadamberparams 19.frcmod 第四步 check 19.frcmod() 第五步 source leaprc.ff03 第六步 ss = loadpdb 1k4f.pdb 第七步 check ss 第八步 saveamberparm ss ss.prmtop ss.inpcrd 可是保存不成功 怎么回事呢Sample Text |
回复此楼» 猜你喜欢
看板上这么多中的，有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉……
已经有4人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有17人回复
-
让我中一个面上吧！
已经有17人回复
-
基金不中，共勉
已经有6人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有8人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
我不理解！
已经有23人回复
-
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战
已经有10人回复
-
系统查不到
已经有10人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于SYBYL分子对接的一些常见问题解答
已经有18人回复
- vmd生成psf文件
已经有1人回复
- ONIOM计算中输入文件准备的问题
已经有1人回复
- 蛋白结够分析软件
已经有1人回复
- pymol
已经有2人回复
- 谁能帮我从PDB库里下一个CDK1 ,CDK2，以及BCL-2蛋白质的PDB结构啊？
已经有9人回复
- 蛋白质分析路线、方法
已经有346人回复
- 【资料】搞蛋白质的童鞋们，甭要只查NCBI了~蛋白质相关数据库启蒙~
已经有135人回复
- gromacs运行出错
已经有3人回复
- 关于GRASP软件和protein surface cavity 分析方面的求教！
已经有3人回复
- 【转帖】用Amber+Gaussian做小分子力场
已经有16人回复
- 鲜为人知的化合物物性查询网站，包括查CA号，一些免费的杂志下载网站！！
已经有247人回复
- 【转帖】分子动画给力细胞世界奇观
已经有2人回复
- 【求助】insightII中蛋白PDB结构删除一个残基后如何把余下的连接起来呀？？？
已经有1人回复
- 【求助】只是优化后文件，没有restart文件，能继续跑吗
已经有22人回复
- 【经验】用Modeller补全残基学习心得
已经有17人回复
wangyan10
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 36 (小学生)
- 金币: 8228.5
- 散金: 118
- 红花: 4
- 帖子: 372
- 在线: 255.5小时
- 虫号: 1089510
- 注册: 2010-09-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2012-03-16 09:11:58
3楼2012-03-28 10:55:22
wangyan10
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 36 (小学生)
- 金币: 8228.5
- 散金: 118
- 红花: 4
- 帖子: 372
- 在线: 255.5小时
- 虫号: 1089510
- 注册: 2010-09-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
4楼2012-03-28 16:54:56
