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guofeng17

新虫 (初入文坛)

[求助] vmd生成psf文件

我是namd的新手,刚看完namd的教程,想做一个蛋白质与单晶硅的相互作用练习一下。现在写完单晶硅的坐标文件了,随便找了一个蛋白质分子,把他们放到一起,保存成了pdb文件,但是现在生成psf文件遇到了问题。按照教程写的一直有错误。我查了一下,好像是拓扑文件的问题,文件没有硅的结构信息。我刚刚接触不太了解,想请教一下,像这种自己写的分子psf怎么生成?拓扑文件只能自己去写吗,可不可以在网上下载到?
  谢谢了!!
temp是我上传了生成的pdb文件
我只有一个b。。。。。。不好意思 求通过
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  • 附件 1 : temp.pdb
  • 2015-08-07 20:28:29, 494.98 K

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王饭饭_

新虫 (初入文坛)

前辈,top怎么操作呀
别灰心,困难总比办法多。。。
2楼2023-02-06 20:29:09
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