应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 在windows下如何将.mol2格式的分子导入database数据库中
91/1返回列表
查看: 2863  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

shouling

金虫 (正式写手)

[求助] 在windows下如何将.mol2格式的分子导入database数据库中

现在正在利用sybyl-x进行分子对接，但是现在有个问题就是我先在sybyl中建立一个数据库，然后我把用chemdraw 3D转换的mol2格式的文件直接拷贝到改文件夹中，奇怪的是在sybyl中file-database-open中打开刚才的数据库时，发现里面根本就什么都没有，请大家帮我看看怎么回事，当然了，金币是少不了的了，希望大家多多献计
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-03-05 13:27:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2012-03-05 15:23:39
open 只是将数据库处于开启状态，import file才是导入
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2012-03-05 15:03:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 15:03:15:
open 只是将数据库处于开启状态，import file才是导入

那请问我怎么样才能将mol2的文件导入到数据库中呢
赞一下 回复此楼
3楼2012-03-05 15:55:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 15:03:15:
open 只是将数据库处于开启状态，import file才是导入

您有QQ吗？咱们还是在QQ上聊吧，我加你
赞一下 回复此楼
4楼2012-03-05 15:56:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-06 00:12:01
御剑江湖(金币+3): 谢谢回帖交流！ 2012-03-14 19:11:29
引用回帖:
3楼: Originally posted by shouling at 2012-03-05 15:55:29:
那请问我怎么样才能将mol2的文件导入到数据库中呢

file-database-new
命名数据库
file-database-open
import file
将mol2导入
将分子命名
file-database-put molecular
就好了
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2012-03-05 23:09:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ky96998

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shouling(金币+20): ★★★很有帮助 2012-03-14 18:42:38
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-04-26 17:29:09
你先把所有的MOL2格式的分子用sybyl-x打开，然后建立一个新的database，然后再再选定所有的分子put into database就行了啊
赞一下 回复此楼
6楼2012-03-13 10:00:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 23:09:12:
file-database-new
命名数据库
file-database-open
import file
将mol2导入
将分子命名
file-database-put molecular
就好了

好的，谢谢，我试试，我怎么给你金币啊
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2012-03-14 18:42:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

d_for

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by shouling at 2012-03-14 18:42:08:
好的，谢谢，我试试，我怎么给你金币啊

怎么将分子命名啊？edit那里是黑色的，导入之后。
赞一下 回复此楼
8楼2012-04-26 17:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

d_for

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by d_for at 2012-04-26 17:17:17:
怎么将分子命名啊？edit那里是黑色的，导入之后。

Reading mol file...
Reading molecule
Unnamed Molecule M1 Not Added to Database
赞一下 回复此楼
9楼2012-04-26 17:19:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shouling 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +8 一鸭鸭哟 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:35 by 沐霖12138
[考研] 304求调剂 +6 小熊joy 2026-03-14 6/300 2026-03-16 12:59 by Iveryant
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-15 6/300 2026-03-16 08:00 by wang_dand
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 材料工程专硕274一志愿211求调剂 +5 薛云鹏 2026-03-15 5/250 2026-03-15 20:38 by Logic2024
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 工科，求调剂 +3 我887 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:39 by JourneyLucky
[考研] 302求调剂 +6 负心者当诛 2026-03-11 6/300 2026-03-13 16:11 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 328化工专硕求调剂 +4 。，。，。，。i 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:44 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生，2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
[考研] 341求调剂 +4 捣蛋猪猪 2026-03-11 4/200 2026-03-12 14:47 by ruiyingmiao
[考研] 哈工大材料324求调剂 +6 闫旭东 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:49 by 星空星月
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭