24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2915  |  回复: 8

shouling

金虫 (正式写手)

[求助] 在windows下如何将.mol2格式的分子导入database数据库中

现在正在利用sybyl-x进行分子对接,但是现在有个问题就是我先在sybyl中建立一个数据库,然后我把用chemdraw 3D转换的mol2格式的文件直接拷贝到改文件夹中,奇怪的是在sybyl中file-database-open中打开刚才的数据库时,发现里面根本就什么都没有,请大家帮我看看怎么回事,当然了,金币是少不了的了,希望大家多多献计
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2012-03-05 15:23:39
open 只是将数据库处于开启状态,import file才是导入
2楼2012-03-05 15:03:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 15:03:15:
open 只是将数据库处于开启状态,import file才是导入

那请问我怎么样才能将mol2的文件导入到数据库中呢
3楼2012-03-05 15:55:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 15:03:15:
open 只是将数据库处于开启状态,import file才是导入

您有QQ吗?咱们还是在QQ上聊吧,我加你
4楼2012-03-05 15:56:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-06 00:12:01
御剑江湖(金币+3): 谢谢回帖交流! 2012-03-14 19:11:29
引用回帖:
3楼: Originally posted by shouling at 2012-03-05 15:55:29:
那请问我怎么样才能将mol2的文件导入到数据库中呢

file-database-new
命名数据库
file-database-open
import file
将mol2导入
将分子命名
file-database-put molecular
就好了
5楼2012-03-05 23:09:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ky96998

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shouling(金币+20): ★★★很有帮助 2012-03-14 18:42:38
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-04-26 17:29:09
你先把所有的MOL2格式的分子用sybyl-x打开,然后建立一个新的database,然后再再选定所有的分子put into database就行了啊
6楼2012-03-13 10:00:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 23:09:12:
file-database-new
命名数据库
file-database-open
import file
将mol2导入
将分子命名
file-database-put molecular
就好了

好的,谢谢,我试试,我怎么给你金币啊
7楼2012-03-14 18:42:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

d_for

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by shouling at 2012-03-14 18:42:08:
好的,谢谢,我试试,我怎么给你金币啊

怎么将分子命名啊?edit那里是黑色的,导入之后。
8楼2012-04-26 17:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

d_for

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by d_for at 2012-04-26 17:17:17:
怎么将分子命名啊?edit那里是黑色的,导入之后。

Reading mol file...
Reading molecule
Unnamed Molecule M1 Not Added to Database
9楼2012-04-26 17:19:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shouling 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 考研调剂生寻找导师 +3 顾瞻考研啊 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:18 by 啵啵啵0119
[考研] 348求调剂 +6 wukira 2026-04-04 6/300 2026-04-05 18:11 by 猪会飞
[考研] 0860 求调剂 一志愿国科大 348 分 +3 WiiiP 2026-04-03 3/150 2026-04-05 17:43 by Ecowxq666!
[考研] 工科求调剂 +15 11ggg 2026-04-03 15/750 2026-04-05 16:24 by zzx2138
[考研] 求调剂,一志愿郑州大学材料与化工专硕,英二数二342分,求老师收留 +18 v12abo 2026-04-02 20/1000 2026-04-05 11:37 by a8144223
[考研] 一志愿江南大学085501机械工程专硕326分,本科佳木斯大学 +5 顾若浮生 2026-04-03 9/450 2026-04-05 09:57 by 1753564080
[考研] 一志愿北京化工大学,初试成绩350求调剂 +9 沿岸?贝壳 2026-04-04 14/700 2026-04-05 01:09 by 沿岸?贝壳
[考研] 调剂 +11 JLLLLLLLLLL 2026-04-03 11/550 2026-04-04 22:21 by hemengdong
[考研] 341求调剂 +3 洛多罗 2026-04-02 4/200 2026-04-04 21:36 by 智能智慧
[考研] 338求调剂 +7 晟功? 2026-04-03 7/350 2026-04-04 20:37 by 蓝云思雨
[考研] +5 雾与海 2026-04-02 6/300 2026-04-04 19:53 by 蓝云思雨
[考研] 求调剂:085600材料与化工,考材科基,总分319 +21 678lucky 2026-03-31 26/1300 2026-04-04 16:22 by dongzh2009
[考研] 求调剂,一志愿北京中医药大学 +3 小小达不溜 2026-04-02 3/150 2026-04-03 22:55 by 冲矢昴星团
[考研] 总分328生物与医药考数学求调剂 +7 aaadim 2026-04-02 9/450 2026-04-03 22:53 by syh9288
[考研] 一志愿重庆大学085404,总分314分,求调剂 +4 zf83hn 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:25 by 啵啵啵0119
[考研] 274求调剂 +10 薛定谔的虎。 2026-04-01 10/500 2026-04-03 10:13 by tianyyysss
[考研] 材料工程322分 +8 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-01 8/400 2026-04-02 11:53 by 3041
[考研] 271求调剂 +15 勒布朗@ 2026-03-31 20/1000 2026-04-02 11:24 by Sammy2
[考研] 279求调剂 +6 学而思兮知 2026-04-01 6/300 2026-04-02 09:16 by vgtyfty
[考研] 生物考研337分求调剂 +4 cgxin 2026-03-30 6/300 2026-03-31 14:18 by 记事本2026
信息提示
请填处理意见