24小时热门版块排行榜    

查看: 2889  |  回复: 8

shouling

金虫 (正式写手)

[求助] 在windows下如何将.mol2格式的分子导入database数据库中

现在正在利用sybyl-x进行分子对接,但是现在有个问题就是我先在sybyl中建立一个数据库,然后我把用chemdraw 3D转换的mol2格式的文件直接拷贝到改文件夹中,奇怪的是在sybyl中file-database-open中打开刚才的数据库时,发现里面根本就什么都没有,请大家帮我看看怎么回事,当然了,金币是少不了的了,希望大家多多献计
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2012-03-05 15:23:39
open 只是将数据库处于开启状态,import file才是导入
2楼2012-03-05 15:03:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 15:03:15:
open 只是将数据库处于开启状态,import file才是导入

那请问我怎么样才能将mol2的文件导入到数据库中呢
3楼2012-03-05 15:55:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 15:03:15:
open 只是将数据库处于开启状态,import file才是导入

您有QQ吗?咱们还是在QQ上聊吧,我加你
4楼2012-03-05 15:56:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-06 00:12:01
御剑江湖(金币+3): 谢谢回帖交流! 2012-03-14 19:11:29
引用回帖:
3楼: Originally posted by shouling at 2012-03-05 15:55:29:
那请问我怎么样才能将mol2的文件导入到数据库中呢

file-database-new
命名数据库
file-database-open
import file
将mol2导入
将分子命名
file-database-put molecular
就好了
5楼2012-03-05 23:09:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ky96998

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shouling(金币+20): ★★★很有帮助 2012-03-14 18:42:38
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-04-26 17:29:09
你先把所有的MOL2格式的分子用sybyl-x打开,然后建立一个新的database,然后再再选定所有的分子put into database就行了啊
6楼2012-03-13 10:00:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 23:09:12:
file-database-new
命名数据库
file-database-open
import file
将mol2导入
将分子命名
file-database-put molecular
就好了

好的,谢谢,我试试,我怎么给你金币啊
7楼2012-03-14 18:42:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

d_for

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by shouling at 2012-03-14 18:42:08:
好的,谢谢,我试试,我怎么给你金币啊

怎么将分子命名啊?edit那里是黑色的,导入之后。
8楼2012-04-26 17:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

d_for

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by d_for at 2012-04-26 17:17:17:
怎么将分子命名啊?edit那里是黑色的,导入之后。

Reading mol file...
Reading molecule
Unnamed Molecule M1 Not Added to Database
9楼2012-04-26 17:19:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shouling 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂院校信息 +4 CX 330 2026-03-21 4/200 2026-03-21 23:48 by ms629
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 一志愿211,0703化学310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-21 22:21 by peike
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +14 曦熙兮 2026-03-15 14/700 2026-03-21 19:12 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿深大,0703化学,总分302,求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 299求调剂 +5 shxchem 2026-03-20 7/350 2026-03-21 17:09 by ColorlessPI
[考研] 机械专硕299求调剂至材料 +3 kkcoco25 2026-03-16 4/200 2026-03-21 03:52 by JourneyLucky
[考研] 材料工程(专)一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 初始318分求调剂(有工作经验) +3 1911236844 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:33 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +9 何润采123 2026-03-18 11/550 2026-03-20 23:19 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +22 rare12345 2026-03-18 22/1100 2026-03-20 20:39 by zhukairuo
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
[考研] 261求B区调剂,科研经历丰富 +3 牛奶很忙 2026-03-20 4/200 2026-03-20 19:34 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工求调剂 +7 为学666 2026-03-16 7/350 2026-03-19 14:48 by 尽舜尧1
[考研] 一志愿,福州大学材料专硕339分求调剂 +3 木子momo青争 2026-03-15 3/150 2026-03-17 07:52 by laoshidan
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 321求调剂 +5 大米饭! 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:33 by houyaoxu
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油!? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
信息提示
请填处理意见