应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 在windows下如何将.mol2格式的分子导入database数据库中
91/1返回列表
查看: 3434  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

shouling

金虫 (正式写手)

[求助] 在windows下如何将.mol2格式的分子导入database数据库中

现在正在利用sybyl-x进行分子对接，但是现在有个问题就是我先在sybyl中建立一个数据库，然后我把用chemdraw 3D转换的mol2格式的文件直接拷贝到改文件夹中，奇怪的是在sybyl中file-database-open中打开刚才的数据库时，发现里面根本就什么都没有，请大家帮我看看怎么回事，当然了，金币是少不了的了，希望大家多多献计
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-03-05 13:27:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+2): 鼓励交流 2012-03-05 15:23:39
open 只是将数据库处于开启状态，import file才是导入
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2012-03-05 15:03:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 15:03:15:
open 只是将数据库处于开启状态，import file才是导入

那请问我怎么样才能将mol2的文件导入到数据库中呢
赞一下 回复此楼
3楼2012-03-05 15:55:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 15:03:15:
open 只是将数据库处于开启状态，import file才是导入

您有QQ吗？咱们还是在QQ上聊吧，我加你
赞一下 回复此楼
4楼2012-03-05 15:56:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhenguo86

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-06 00:12:01
御剑江湖(金币+3): 谢谢回帖交流！ 2012-03-14 19:11:29
引用回帖:
3楼: Originally posted by shouling at 2012-03-05 15:55:29:
那请问我怎么样才能将mol2的文件导入到数据库中呢

file-database-new
命名数据库
file-database-open
import file
将mol2导入
将分子命名
file-database-put molecular
就好了
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2012-03-05 23:09:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ky96998

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
shouling(金币+20): ★★★很有帮助 2012-03-14 18:42:38
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-04-26 17:29:09
你先把所有的MOL2格式的分子用sybyl-x打开，然后建立一个新的database，然后再再选定所有的分子put into database就行了啊
赞一下 回复此楼
6楼2012-03-13 10:00:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shouling

金虫 (正式写手)
引用回帖:
楼: Originally posted by zhenguo86 at 2012-03-05 23:09:12:
file-database-new
命名数据库
file-database-open
import file
将mol2导入
将分子命名
file-database-put molecular
就好了

好的，谢谢，我试试，我怎么给你金币啊
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2012-03-14 18:42:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

d_for

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by shouling at 2012-03-14 18:42:08:
好的，谢谢，我试试，我怎么给你金币啊

怎么将分子命名啊？edit那里是黑色的，导入之后。
赞一下 回复此楼
8楼2012-04-26 17:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

d_for

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by d_for at 2012-04-26 17:17:17:
怎么将分子命名啊？edit那里是黑色的，导入之后。

Reading mol file...
Reading molecule
Unnamed Molecule M1 Not Added to Database
赞一下 回复此楼
9楼2012-04-26 17:19:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shouling 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 27博士申请 +3 白白白ly 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:39 by szq0819
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 3/150 2026-11-09 21:05 by FChKX8meu1ds
[文学芳草园] 厉娜 +3 张丹枫1991 2026-11-09 5/250 2026-11-09 16:53 by 张丹枫1991
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 15/750 2026-11-09 13:19 by Equinoxhua
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 14/700 2026-11-09 11:52 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 16/800 2026-11-09 11:47 by GwrQVVR6Oenx
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 15/750 2026-11-09 11:41 by GwrQVVR6Oenx
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 10/500 2026-11-09 08:00 by IhnEQauGmT3K
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 12/600 2026-11-09 06:32 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-09 00:14 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 8/400 2026-11-08 23:01 by l48hFd8Nwae2
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 9/450 2026-11-08 22:46 by l48hFd8Nwae2
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:12 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 kvewwGtKktqB 2026-11-04 16/800 2026-11-06 05:00 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 10/500 2026-11-06 02:04 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭